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玉米穗位高全基因组关联分析及其候选基因预测
引用本文:李博,张焕欣,杨小艳,吕颖颖,江培顺,郝转芳,吕香玲,王宏伟,翁建峰.玉米穗位高全基因组关联分析及其候选基因预测[J].作物杂志,2013(2):27-32.
作者姓名:李博  张焕欣  杨小艳  吕颖颖  江培顺  郝转芳  吕香玲  王宏伟  翁建峰
作者单位:1. 沈阳农业大学农学院,110000,辽宁沈阳
2. 中国农业科学院作物科学研究所/作物分子育种国家工程实验室,100081,北京
3. 重庆市农业科学院生物技术研究中心,404100,重庆
基金项目:国家自然科学基金项目(31201219);973项目(2011CB100106)
摘    要:利用41 101个SNP标记对159份我国玉米自交系进行全基因组分析.通过控制群体结构和亲缘关系,采取混合线性模型,检测到7个与穗位高显著相关SNP(P <0.0001),并确定7个候选基因,其注释功能有GABA-B受体活性、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性、组蛋白-赖氨酸N-甲基转移酶活性、转运活性、翻译起始因子活性和酰胺基tRNA水解酶活性.利用BioMercator2-1软件将收集的137个稳位高QTL整合至IBM2 2008Neighbors玉米遗传图谱上,确定19个“一致性”QTL,结合分析7个与穗位高显著相关的SNP位点信息,获得2个候选基因.

关 键 词:玉米  穗位高  全基因组关联分析  元分析

Genome-Wide Association Study and Candidate Gene Prediction of Ear Height in Maize (Zea mays L.)
Li Bo,Zhang Huanxin,Yang Xiaoyan,Lv Yingying,Jiang Peishun,Hao Zhuanfang,Lv Xiangling,Wang Hongwei,Weng Jianfeng.Genome-Wide Association Study and Candidate Gene Prediction of Ear Height in Maize (Zea mays L.)[J].Crops,2013(2):27-32.
Authors:Li Bo  Zhang Huanxin  Yang Xiaoyan  Lv Yingying  Jiang Peishun  Hao Zhuanfang  Lv Xiangling  Wang Hongwei  Weng Jianfeng
Institution:1 Agronomy College of Shenyang Agricultural University,Shenyang 110000,Liaoning;2 Institute of Crop Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences / National Key Facility for Crop Gene Resource and Genetic Improvement,100081,Beijing;3 Biotechnology Research Center,Chongqing Academy of Agricultural Scinces,404100,Chongqing,China)
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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