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15株湖南省猪圆环病毒2型全基因组测序与遗传进化分析
引用本文:何世成,王紫微,丁朝阳,胡巧云,唐小明,王卫国,谢怡灵,王昌建.15株湖南省猪圆环病毒2型全基因组测序与遗传进化分析[J].中国动物检疫,2022,39(2):33-39.
作者姓名:何世成  王紫微  丁朝阳  胡巧云  唐小明  王卫国  谢怡灵  王昌建
作者单位:湖南省动物疫病预防控制中心;衡阳技师学院;娄底市动物疫病预防控制中心
基金项目:湖南省生猪产业体系岗位专家基金项目
摘    要:为了解湖南省猪圆环病毒2型(PCV2)的遗传变异情况,以PCV2检测阳性样本DNA为模板进行全基因组测序和遗传特征分析。共获得的15株PCV2全基因组,其中10株为PCV2d基因亚型,3株为PCV2b基因亚型,2株为PCV2a基因亚型;15株PCV2全基因组同源性为94.7%~99.9%,与国内外其他PCV2全基因组同源性为93.1%~100%。PCV2a的第77、86~91、151、206和222位,PCV2b的第57、89及210位,PCV2d的第53、68、121、134、215和234位氨基酸与其他亚型存在差异。结果表明,2017—2020年湖南省主要流行PCV2d亚型,不同亚型之间ORF2氨基酸序列差异较大,但同亚型之间氨基酸序列无明显变异。本研究为湖南省PCV2研究及该病防治提供了数据支撑。

关 键 词:猪圆环病毒2型  全基因扩增  遗传进化分析  湖南

Genome Sequencing and Genetic Evolution Analysis of 15 Strains of PCV2 in Hunan Province
He Shicheng,Wang Ziwei,Ding Zhaoyang,Hu Qiaoyun,Tang Xiaoming,Wang Weiguo,Xie Yiling,Wang Changjian.Genome Sequencing and Genetic Evolution Analysis of 15 Strains of PCV2 in Hunan Province[J].China Journal Of Animal Quarantine,2022,39(2):33-39.
Authors:He Shicheng  Wang Ziwei  Ding Zhaoyang  Hu Qiaoyun  Tang Xiaoming  Wang Weiguo  Xie Yiling  Wang Changjian
Institution:(Hunan Animal Disease Prevention and Control Center,Changsha,Hunan 410014,China;Hengyang Technician College,Hengyang,Hunan 421101,China;Loudi Animal Disease Prevention and Control Center,Loudi,Hunan 417000,China)
Abstract:
Keywords:PCV2  whole gene amplification  genetic evolution analysis  Hunan Province
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