湿加松的SSR反应体系优化 |
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作者姓名: | 陈考科 黄少伟 |
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作者单位: | 阳江市林业科学研究所,广东阳江,529500;华南农业大学林学院;华南农业大学林学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金,国家重点基础研究发展计划 |
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摘 要: | 对湿加松SSR反应体系中模板DNA的用量、Mg^2+浓度、dNTPs及Taq酶的用量、变性温度、退火温度、反应循环次数共7个影响SSR扩增效果的因素,逐一设置单因素多水平进行试验,以目测比较确定谱带条数、亮度、清晰度、背景透明度以及结果的重复性等为判定反应条件适合程度的指标,其反应体系为25uL,扩增程序经优化后确定为:10ng的模板、1×PCR缓冲液、2.5mM的Mg^2+、0.2mMdNTPs、0.6UTaq酶、正反向引物各0.2uM;最优反应程序为94℃预变性2min之后进入循环,每个循环94℃变性45s,退火45S,72℃延伸45S。退火温度从Tm开始,每隔2个循环降低1℃,直至(Tm-10℃),维持40个循环。循环结束,72℃延伸5min。
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关 键 词: | 湿加松 SSR 体系优化 |
收稿时间: | 2008-08-13 |
修稿时间: | 2008-10-10 |
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