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瓯江彩鲤酪氨酸酶(TYR)基因的选择压力分析
引用本文:古珍珍,杨新鑫,胡建尊,项松平,王剑,王军,徐志彬,王成辉.瓯江彩鲤酪氨酸酶(TYR)基因的选择压力分析[J].上海海洋大学学报,2016,25(3):329-336.
作者姓名:古珍珍  杨新鑫  胡建尊  项松平  王剑  王军  徐志彬  王成辉
作者单位:上海海洋大学 农业部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306,上海海洋大学 农业部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306,上海海洋大学 农业部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306,浙江省龙泉市水利水电局, 浙江 龙泉 323700,浙江龙泉省级瓯江彩鲤良种场, 浙江 龙泉 323700,上海海洋大学 农业部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306,浙江省龙泉市水利水电局, 浙江 龙泉 323700,上海海洋大学 农业部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306
基金项目:国家自然科学基金(30907725,31372521);上海市科学技术委员会项目(15391900800)
摘    要:酪氨酸酶是生物体黑色素合成的关键限速酶,黑色斑纹是瓯江彩鲤(Cyprinus carpio var. color) 体色的主要特点之一。以瓯江彩鲤的5种体色选育系F5为材料,探讨酪氨酸酶基因5个外显子及其在不同体色间的变异特性和承受选择压力的敏感性。结果发现:酪氨酸酶基因外显子1和外显子5的核苷酸变异率最高,选择性位点最多,易承受到选择压力;5个外显子的非同义替换率(dN) 与同义替换率(dS) 的比值(ω值)均小于1(0.10~0.67),表明它们均受到净化选择压力;不同体色瓯江彩鲤的酪氨酸酶基因也均受到净化选择压力(ω=0.12~0.23)。应用PAML软件中的M2a和M8两种模型检测显示:无黑斑体色瓯江彩鲤所受正向选择压力位点数高于有黑斑体色,但不存在显著差异(P>0.05);酪氨酸酶基因中的部分氨基酸位点较易受正向选择压力。研究结果表明:瓯江彩鲤酪氨酸酶基因较保守,主要受净化选择作用,当前的人工选育未对酪氨酸酶基因造成显著的选择压力。

关 键 词:瓯江彩鲤  酪氨酸酶基因  选择压力  遗传变异
收稿时间:9/1/2015 12:00:00 AM
修稿时间:2015/12/3 0:00:00

Selection pressure analysis of tyrosinase (TYR) gene in Oujiang color common carp (Cyprinus carpio var. color)
GU Zhenzhen,YANG Xinxin,HU Jianzun,XIANG Songping,WANG Jian,WANG Jun,XU Zhibin and WANG Chenghui.Selection pressure analysis of tyrosinase (TYR) gene in Oujiang color common carp (Cyprinus carpio var. color)[J].Journal of Shanghai Ocean University,2016,25(3):329-336.
Authors:GU Zhenzhen  YANG Xinxin  HU Jianzun  XIANG Songping  WANG Jian  WANG Jun  XU Zhibin and WANG Chenghui
Institution:Key Laboratory of Freshwater Fisheries Germplasm Resources, Ministry of Agriculture, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China,Key Laboratory of Freshwater Fisheries Germplasm Resources, Ministry of Agriculture, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China,Key Laboratory of Freshwater Fisheries Germplasm Resources, Ministry of Agriculture, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China,Longquan Water Conservancy and Hydropower Bureau in Longquan City, Longquan 323700, Zhejiang, China,The Provincial Farm of Oujiang Color Common Carp, Longquan 323700, Zhejiang, China,Key Laboratory of Freshwater Fisheries Germplasm Resources, Ministry of Agriculture, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China,Longquan Water Conservancy and Hydropower Bureau in Longquan City, Longquan 323700, Zhejiang, China and Key Laboratory of Freshwater Fisheries Germplasm Resources, Ministry of Agriculture, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China
Abstract:
Keywords:Cyprinus carpio var  color  tyrosinase gene  selection pressure  genetic variation
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