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甘薯抗病基因同源序列的克隆与分析
引用本文:王钰,王荣富,何国浩. 甘薯抗病基因同源序列的克隆与分析[J]. 南京农业大学学报, 2008, 31(3)
作者姓名:王钰  王荣富  何国浩
作者单位:安徽农业大学生命科学学院,安徽,合肥,230036;安徽大学生命科学学院/安徽省生态环境与生物技术重点实验室,安徽,合肥,230039;安徽农业大学生命科学学院,安徽,合肥,230036;美国Tuskegee,大学农学、自然与环境学院,阿拉巴马,36088
摘    要:对根据紫花苜蓿(Medicago truncatula)NBS区域的保守序列等设计的16对简并引物进行优化,筛选出6对简并引物,以甘薯的基因组DNA为模板进行PCR扩增,克隆甘薯抗病基因同源序列(RGA)。结果克隆出342个不同的甘薯RGA,这342个甘薯RGA和已知的抗病基因历、N、RGCl等具有高度同源性(Evalue〈e×10^-20)。根据抗病基因同源序列的相似性,利用Cluxtalw软件将其分为22个不同的类群。这些甘薯的抗病基因同源序列已提交GenBank(编号:DQ903322至DQ903664)。在342个甘薯RGA中,除7个是TIR外,其余属于DOD—TIR类型。用Blastx和DNAman软件对342个甘薯RGA进行列队比较,发现有9个含有抗线虫病RGC1序列的RGA,它们与RGC1的同源件为50%~100%.

关 键 词:甘薯  简并引物  抗病基因同源序列(RGA)  克隆

Cloning of resistance gene analog(RGA)from sweetpotato (Ipomoea batatas(L.)Lam)
WANG Yu,WANG Rong-fu,HE Guo-hao. Cloning of resistance gene analog(RGA)from sweetpotato (Ipomoea batatas(L.)Lam)[J]. Journal of Nanjing Agricultural University, 2008, 31(3)
Authors:WANG Yu  WANG Rong-fu  HE Guo-hao
Abstract:
Keywords:
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