小鼠GnIH基因克隆及生物信息学分析

目的:对小鼠促性腺激素抑制激素(GnIH)基因进行克隆,同时采用生物信息学方法分析其蛋白序列。方法:提取雌性小鼠卵巢总RNA,根据小鼠GnIH基因的开放性阅读框设计引物,采用逆转录PCR(RT-PCR)扩增GnIH基因,并对其产物进行鉴定;利用生物信息学软件对GnIH蛋白的结构及功能进行预测。结果:GnIH基因的RT-PCR扩增产物与预期一致,大小为567 bp,测序结果与GenBank已发表序列完全一致;小鼠GnIH蛋白有188个氨基酸,其分子式为C_(926)H_(1483)N_(273)O_(273)S_8,分子量为21 065.11,理论等电点(pI)为9.86,GnIH蛋白的二级结构为alphabeta型,含有6个疏水性较高的区域(临界值2.0)。此外,GnIH蛋白为信号肽蛋白,主要分布于细胞核,具有众多的磷酸化酶位点。结论:小鼠GnIH蛋白为一种疏水性信号肽,在参与细胞信号转导及细胞凋亡调控中发挥重要作用,为其细胞功能研究提供了基础资料。