| 甘蓝型油菜BnTT3基因的表达与eQTL定位分析 |
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| 引用本文： | 卢坤,曲存民,李莎,赵会彦,王瑞,徐新福,梁颖,李加纳.甘蓝型油菜BnTT3基因的表达与eQTL定位分析[J].作物学报,2015,41(11):1758-1766. |
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| 作者姓名： | 卢坤 曲存民 李莎 赵会彦 王瑞 徐新福 梁颖 李加纳 |
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| 作者单位： | 1 西南大学农学与生物科技学院, 重庆 400715; 2 重庆市油菜工程技术研究中心, 重庆 400715 |
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| 基金项目： | 本研究由国家自然科学基金项目(31401412, U1302266), 国家科技支撑计划项目(2013BAD01B03-12), 重庆市主要农作物良种创新工程项目(cstc2012ggB80008), 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-13), 国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2013AA102602), 111人才引智基地建设项目(B12006)和中央高校基本科研业务费专项资金(XDJK2012A009, 2362015xk05)资助。 |
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| 摘 要： | 类黄酮途径中,TT3编码的4-二氢黄铜醇还原酶是参与原花色素和花青素合成的关键酶。为了明确该基因可能的上游调控网络,利用黄籽母本GH06和黑籽父本ZY821构建的遗传图谱,以Bn TT3基因在高世代重组自交系群体中随机选取的94个株系花后40 d种子的表达量作为性状,采用复合区间作图法进行e QTL分析。结果共检测到5个表达量相关的e QTL,分别位于A03、A08、A09和C01染色体,单个e QTL解释表型变异的5.22%~24.05%。A09染色体上存在2个主效e QTL,单个e QTL分别解释24.05%和16.55%的表型变异,分别位于标记KS10260~KBr B019I24.15和B055B21-5~KS30880之间,微效e QTL分布于A03、A08和C01染色体上。A09染色体上的2个主效e QTL区间(包含200 kb侧翼序列)与拟南芥、白菜、甘蓝和芸薹族近缘物种基因组同源区段具有很好的共线性关系。基因注释结果表明检测到的e QTL均为trans-QTL,2个主效e QTL区段共包含78个基因,包括MYB51、MYB52和b ZIP5转录因子,可能为Bn TT3基因的上游直接调控因子,对这些基因功能的深入分析将有助于阐明甘蓝型油菜黄籽性状形成的分子调控机制,为黄籽候选基因的克隆筛选奠定基础。
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| 关 键 词： | 甘蓝型油菜 种子 TT3 重组自交系 表达数量性状位点 |
| 收稿时间： | 2015-01-19 |
Expression Analysis and eQTL Mapping of BnTT3 Gene in Brassica napus L. |
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| LU Kun,QU Cun-Min,LI Sha,ZHAO Hui-Yan,WANG Rui,XU Xin-Fu,LIANG Ying,LI Jia-Na.Expression Analysis and eQTL Mapping of BnTT3 Gene in Brassica napus L.[J].Acta Agronomica Sinica,2015,41(11):1758-1766. |
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| Authors: | LU Kun QU Cun-Min LI Sha ZHAO Hui-Yan WANG Rui XU Xin-Fu LIANG Ying LI Jia-Na |
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| Institution: | 1.College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Chongqing 400715, China;2.Chongqing Rapeseed Engineering Research Center, Chongqing 400715, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Brassica napus L Seeds TRANSPARENT TESTA 3 Recombinant inbred lines (RILs) Expression quantitative trait locus (eQTL) |
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