| 牡丹LINE 类反转录转座子RT 序列的克隆及分析 |
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| 引用本文： | 宋程威,郭大龙,张 曦,郭丽丽,侯小改.牡丹LINE 类反转录转座子RT 序列的克隆及分析[J].园艺学报,2014,41(1):157-164. |
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| 作者姓名： | 宋程威 郭大龙 张 曦 郭丽丽 侯小改 |
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| 作者单位： | 1 河南科技大学农学院，河南洛阳 471003；2 河南科技大学林学院，河南洛阳 471003；3 河南省高校牡丹工程技术
中心，河南洛阳 471003 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31070620）；洛阳市科技攻关项目（1102061A）；河南省高校科技创新人才支持计划项目
（13HASTIT004）；河南省重点科技攻关项目（132102110029） |
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| 摘 要： | 利用LINE 简并引物从中原牡丹品种‘洛阳红’中扩增出580 bp 左右的目的条带，对其回
收、克隆、测序及相关生物信息学软件分析后获得32 条LINE 类牡丹反转录转座子RT（反转录酶）序列。
这些序列长度为547 ~ 593 bp，主要表现为点突变，经Clustal W 比对其同源性为25.7% ~ 94.2%。将其核
苷酸序列经聚类后可分为4 个家族，其中家族Ⅰ和 Ⅲ 分别占总序列数的50%和28%。将32 条RT 序列翻
译成氨基酸序列，在第18 氨基酸序列处有1 个非常保守的的甘氨酸（Gly），在138 氨基酸序列处有1 个
半保守的赖氨酸（Lys）位点。32 条序列均发生较多的终止密码子突变和移码突变。与其他物种的系统进
化树分析，表明牡丹LINE 类反转录转座子RT 序列既有一定的保守性，同时也与其他物种间存在一定的
同源性。
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| 关 键 词： | 牡丹 非LTR 类反转录转座子 反转录酶 |
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