| 苹果脱水素基因生物信息学识别与表达分析 |
| |
| 引用本文： | 冯闯,王珊珊,赵晨辉,李粤渤,宋宏伟,李红莲,张冰冰,梁英海. 苹果脱水素基因生物信息学识别与表达分析[J]. 分子植物育种, 2022, 20(4): 1112-1118. DOI: 10.13271/j.mpb.020.001112 |
| |
| 作者姓名： | 冯闯 王珊珊 赵晨辉 李粤渤 宋宏伟 李红莲 张冰冰 梁英海 |
| |
| 作者单位： | 吉林省农业科学院果树研究所,公主岭,136100;延边大学农学院,延吉,133002,吉林省农业科学院果树研究所,公主岭,136100 |
| |
| 基金项目： | 吉林省农业科技创新工程研究生基金 |
| |
| 摘 要： | ![]()
本研究使用Perl语言在‘金冠’苹果基因组中识别脱水素基因(MD-DHN)序列，并对MD-DHN系统发生关系、保守序列、氨基酸一级结构以及疏水性等进行了生物信息学分析，并利用低温处理下‘金红’、‘金冠’苹果转录组测序数据，分析了MD-DHN表达差异。在‘金冠’苹果基因组中，共识别17个MD-DHN，根据系统发生关系可以归类为I、Ⅱ、Ⅲ3个亚族，I类亚族的成员最多，Ⅲ类亚族最少，均包含Y、S、K序列区，但I类亚族K区一致性不高。17个MD-DHN蛋白都具有高亲水性，但是不同蛋白序列之间亲水性存在差异。17个MD-DHN中，有11个MD-DHN响应苹果冷胁迫和冰冻胁迫，其中10个脱水素基因(MDDHN1～MD-DHN5, MD-DHN8～MD-DHN10, MD-DHN13和MD-DHN15)在冰冻胁迫下，在更耐寒‘金红’苹果中高表达。本研究为进一步探讨MD-DHN基因功能提供了依据。
|
| 关 键 词： | 苹果 脱水素 生物信息学 低温胁迫 氨基酸亲水性 |
Bioinformatics Identification and Expression Analysis of Dehydrin Genes in Malus domestic a |
| |
| Feng Chuang,Wang Shanshan,Zhao Chenhui,Li Yuebo,Song Hongwei,Li Honglian,Zhang Bingbing,Liang Yinghai. Bioinformatics Identification and Expression Analysis of Dehydrin Genes in Malus domestic a[J]. Molecular Plant Breeding, 2022, 20(4): 1112-1118. DOI: 10.13271/j.mpb.020.001112 |
| |
| Authors: | Feng Chuang Wang Shanshan Zhao Chenhui Li Yuebo Song Hongwei Li Honglian Zhang Bingbing Liang Yinghai |
| |
| Abstract: | ![]()
|
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
