| 小麦盐应答基因TaSR1的生物信息学鉴定及表达验证 |
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| 引用本文： | 白子彧,丁 博,李 杨,陈小强,李迎霞,杜亚军,郭 雨,谢晓东.小麦盐应答基因TaSR1的生物信息学鉴定及表达验证[J].麦类作物学报,2017(3):307-311. |
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| 作者姓名： | 白子彧 丁 博 李 杨 陈小强 李迎霞 杜亚军 郭 雨 谢晓东 |
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| 作者单位： | 天津农学院农学与资源环境学院,天津,300384 |
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| 基金项目： | 国家大学生创新创业训练计划项目（201410061004，201510061047）；天津市131创新型人才团队计划项目；天津市高校学科领军人才培养计划项目 |
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| 摘 要： | 为发掘小麦盐应答相关基因,利用Genevestigator在线生物信息学程序,分析了25个试验中118个样品的盐胁迫试验的转录组数据,筛选到2个盐应答候选基因。以中国春小麦为试验材料,将其三叶一心期幼苗根系置于200mmol·L~(-1)的NaCl溶液中,分别处理0、0.5、1、2、4和8h,分析候选基因的表达模式。结果表明,其中1个候选基因的表达模式与生物信息学分析结果相近,受盐胁迫诱导明显上调表达,命名为TaSR1。该基因编码区含有948个核苷酸,编码315个氨基酸。TaSR1蛋白含有KRTAP和PHA01732两个保守结构域,富含脯氨酸残基。
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| 关 键 词： | 小麦 生物信息学 盐应答基因 表达验证 |
Bioinformatic Screening and Expression Validation of Salt Responsive Gene TaSR1 in Wheat |
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| BAI Ziyu,DING Bo,LI Yang,CHEN Xiaoqiang,LI Yingxi,DU Yajun,GUO Yu,XIE Xiaodong.Bioinformatic Screening and Expression Validation of Salt Responsive Gene TaSR1 in Wheat[J].Journal of Triticeae Crops,2017(3):307-311. |
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| Authors: | BAI Ziyu DING Bo LI Yang CHEN Xiaoqiang LI Yingxi DU Yajun GUO Yu XIE Xiaodong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Wheat Bioinformatics Salt-responsive gene Expression validation |
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