| 甘蓝型油菜ＨＭＧ基因家族的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李春金,郭媛媛,杨启航,王彤,王秋梅,冯书燕,胡静静,裴巧英,李野默,丁洪玲,宋小明.甘蓝型油菜ＨＭＧ基因家族的生物信息学分析[J].中国油料作物学报,2018,40(3):318. |
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| 作者姓名： | 李春金 郭媛媛 杨启航 王彤 王秋梅 冯书燕 胡静静 裴巧英 李野默 丁洪玲 宋小明 |
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| 作者单位： | １．华北理工大学生命科学学院，河北唐山，０６３２１０；２．华北理工大学现代技术教育中心，河北唐山，０６３２１０ |
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| 基金项目： | 河北省自然科学基金（Ｃ２０１７２０９１０３）；华北理工大学２０１７年度大学生创新创业训练计划校级项目（Ｘ２０１７１８６）；华北理工大学博士
科研启动经费项目（宋小明） |
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| 摘 要： | 为研究甘蓝型油菜HMG（high mobility group）基因家族的起源、进化和功能，利用生物信息学方法对甘蓝型油菜和其近缘物种HMG基因家族进行鉴定，并对其进化、基因结构、组织表达、直系旁系同源基因进行系统分析。在甘蓝型油菜中鉴定到45个HMG家族成员，并根据进化树和基因结构将其分成5组。染色体定位发现，19条染色体中有18条染色体有HMG基因，说明该家族基因分布较广泛。在甘蓝型油菜与甘蓝、白菜和拟南芥分别鉴定到47、45和26个直系同源基因对。在甘蓝型油菜中鉴定到28个旁系同源基因对，而在其它3个物种中则比较少，这可能与甘蓝型油菜的多次基因组加倍有关。对45个甘蓝型油菜BnHMG基因在根和叶中的表达模式进行分析，结果显示，大多数基因在根和叶中均有表达，且呈现出不同的表达模式。
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| 关 键 词： | 甘蓝型油菜 HMG基因家族 系统进化 染色体定位 直系同源基因 旁系同源基因 基因表达 |
Bioinformatic analysis of HMG gene family in rapeseed (Brassica napus L.) |
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| LI Chun-jin,GUO Yuan-yuan,YANG Qi-hang,WANG Tong,WANG Qiu-mei,FENG Shu-yan,HU Jing-jing,PEI Qiao-ying,LI Ye-mo,DING Hong-ling,SONG Xiao-ming.Bioinformatic analysis of HMG gene family in rapeseed (Brassica napus L.)[J].Chinese Journal of Oil Crop Sciences,2018,40(3):318. |
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| Authors: | LI Chun-jin GUO Yuan-yuan YANG Qi-hang WANG Tong WANG Qiu-mei FENG Shu-yan HU Jing-jing PEI Qiao-ying LI Ye-mo DING Hong-ling SONG Xiao-ming |
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| Institution: | 1. College of Life Sciences, North China University of Science and Technology, Tangshan 063210, China; 2. Modern technology and education center, North China University of Science and Technology, Tangshan 063210, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Brassica napus L HMG gene family system evolution chromosome location orthologs gene paralogs gene gene expression |
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