| 荞麦根的转录组学分析及黄酮合成基因的鉴定 |
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| 引用本文： | 黄娟,邓娇,陈庆富. 荞麦根的转录组学分析及黄酮合成基因的鉴定[J]. 中国农业科技导报, 2017, 19(2): 9-19. DOI: 10.13304/j.nykjdb.2016.206 |
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| 作者姓名： | 黄娟 邓娇 陈庆富 |
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| 作者单位： | 贵州师范大学, 荞麦产业技术研究中心, 贵阳 550001 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31471562)；国家现代农业产业技术体系专项(CARS-08-A4)；贵州省科学技术基金计划项目(2016GZ73702)；贵州省荞麦工程技术研究中心项目(黔科合农G字[2015]4003号)资助。 |
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| 摘 要： | 荞麦基因资源相对匮乏。以甜荞根和金荞根为材料,利用Illumina Hi SeqTM2000对其进行转录组测序,经过de novo从头组装得到64 618条Unigene,其中37 546条基因得到了有效注释。对甜荞根和金荞根中的差异基因进行筛选,共获得了4 709个差异基因,其中2 460个上调表达,2 249个下调表达。这些差异基因的GO注释集中在10个细胞组分(cellular component)、12个分子功能(molecular function)和22个生物学过程(biological process)中。对差异基因参与的代谢途径进行富集,上调基因中共有40个代谢途径显著富集,下调基因中共有18个代谢途径显著富集,这些显著富集的代谢途径参与甜荞根和金荞根的生物学调控。最后对转录组中注释到黄酮合成途径中的关键基因进行了分析,共有21个基因注释到黄酮合成途径中的关键酶。不仅丰富了荞麦的基因资源,为荞麦分子生物学研究提供数据基础,也为筛选甜荞根和金荞根中相关基因的表达趋势提供参考依据。
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| 关 键 词： | 荞麦 转录组 从头组装 差异基因 黄酮合成基因 |
Transcriptome Analysis of Fagopyrum Root and Identification of Genes Involved in Flavonoid Biosynthesis |
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| HUANG Juan,DENG Jiao,CHEN Qingfu. Transcriptome Analysis of Fagopyrum Root and Identification of Genes Involved in Flavonoid Biosynthesis[J]. Journal of Agricultural Science and Technology, 2017, 19(2): 9-19. DOI: 10.13304/j.nykjdb.2016.206 |
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| Authors: | HUANG Juan DENG Jiao CHEN Qingfu |
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| Affiliation: | Research Center of Buckwheat Industry Technology, Guizhou Normal University, Guiyang 550001, China |
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