| 菠萝R2R3-MYB基因家族鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 陈哲,胡福初,阮城城,范鸿雁,郭利军,张治礼.菠萝R2R3-MYB基因家族鉴定与表达分析[J].热带作物学报,2019,40(10):1958-1971. |
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| 作者姓名： | 陈哲 胡福初 阮城城 范鸿雁 郭利军 张治礼 |
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| 作者单位： | 海南省农业科学院热带果树研究所/海南省热带果树生物学重点实验室/农业农村部海口热带果树科学观测实验站,海南海口 571100 |
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| 基金项目： | 海南省科协青年科技英才学术创新计划项目(QCXM201803);国家自然科学基金项目(31260460);国家自然科学基金项目(31960589);海南省农业科学院农业科技创新专项 |
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| 摘 要： | R2R3-MYB转录因子参与植物众多生命活动的调控,在植物生长发育中至关重要。本研究采用生物信息学分析方法,从菠萝基因组中筛选鉴定R2R3-AcMYB转录因子,并对其基因结构、编码蛋白和系统进化进行了分析;基于转录组数据和荧光定量PCR分析,研究了乙烯利处理后菠萝顶端分生组织MYB基因的表达模式。研究结果显示,菠萝基因组含有103个R2R3-AcMYB转录因子,其中67个的基因结构组成为3（外显子）+2（内含子）,17个为2（外显子）+1（内含子）。103个R2R3-AcMYB蛋白中,有31个偏碱性,55个显酸性和17个呈中性。亚细胞定位预测显示,有67个编码蛋白定位于细胞质,20个定位于细胞核。保守基序分析发现,有91个R2R3-AcMYB的序列包含SANT结构的motif 1和motif 2。系统进化树分析表明,81个R2R3-AcMYB转录因子可以分别被归入18个亚组,其余22个R2R3-AcMYB转录因子则未能进行明确归类。基于转录组数据和荧光定量PCR分析结果,发现菠萝顶端分生组织中多个MYB基因的表达受到乙烯利的诱导或抑制,暗示这些基因可能参与了乙烯利诱导条件下菠萝生长发育（包括开花诱导等）调控。这些研究结果为进一步挖掘菠萝激素响应、生长发育和开花调控等基因,揭示菠萝生长发育调控机制提供了数据支持。
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| 关 键 词： | 菠萝 R2R3-MYB 生物信息学 乙烯利 基因表达 |
| 收稿时间： | 2019-05-10 |
Bioinformatics and Gene Expression Analysis of Pineapple R2R3- MYB Gene Family |
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| CHEN Zhe,HU Fuchu,RUAN Chengcheng,FAN Hongyan,GUO Lijun,ZHANG Zhili.Bioinformatics and Gene Expression Analysis of Pineapple R2R3- MYB Gene Family[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2019,40(10):1958-1971. |
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| Authors: | CHEN Zhe HU Fuchu RUAN Chengcheng FAN Hongyan GUO Lijun ZHANG Zhili |
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| Institution: | Institute of Tropical Fruit Trees, Hainan Academy of Agricultural Sciences / Key Laboratory of Tropical Fruit Tree Biology of Hainan Province / Haikou Investigation Station of Tropical Fruit Trees, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Haikou, Hainan 571100, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | pineapple R2R3-MYB bioinformatics ethrel gene expression |
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