| 浑浊红球菌LPD06283蛋白的生物信息学分析 |
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| 作者姓名： | 马学婧 白静 韩靖轩 柏潇萌 韩然 李泊颖 郝雅如 张兆英 |
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| 作者单位： | 1.沧州师范学院生命科学系,河北 沧州 061001;2.沧州职业技术学院农牧工程系,河北 沧州 061001 |
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| 基金项目： | 河北省教育厅科学技术研究项目 ( QN2020515 );沧州师范学院校内科研基金项目 ( XNJJLQN2021002 );沧州师范学院校内科研基金项目 ( XNJJL1907 ) |
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| 摘 要： | 试验旨在探究浑浊红球菌PD630(Rhodococcus opacus PD630)LPD06283蛋白的结构与功能.采用生物信息学方法对LPD06283蛋白的理化性质、亲水性、疏水性、双性α螺旋、同源性、信号肽、跨膜区、二级结构、结构域、三级结构、磷酸化修饰位点、相互作用蛋白质进行研究.结果显示,LPD06283蛋白是一种稳定酸性亲水蛋白,N端疏水区形成双性α螺旋,与红球菌RHA1(Rhodococcus jostii RHA1)MLDS蛋白的亲缘关系较近,无信号肽和跨膜区;LPD06283蛋白的二级结构由α螺旋(81.88％)、β转角(3.62％)和无规则卷曲(14.49％)构成,N端存在一个载脂蛋白结构域,三级结构采用综合法预测得到且质量较高;LPD06283蛋白含有19个磷酸化位点,相互作用最强的蛋白质是XRE家族DNA结合蛋白.研究表明,LPD06283蛋白可能参与浑浊红球菌的脂质代谢,可作为微生物油脂研发的潜在靶标.
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| 关 键 词： | LPD06283蛋白 浑浊红球菌PD630 微生物油脂 蛋白结构 生物信息学分析 |
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