|
|||||
|
|
| 泥东风螺EST-SSR开发及其群体遗传多样性分析 | |
| 作者姓名： | 熊钢 王晓清 王佩 陈贞年 周先文 康骊 曾志南 |
| 作者单位： | 湖南生物机电职业技术学院动物科技系 长沙 410127；湖南农业大学动物科技学院 长沙 410128;湖南农业大学动物科技学院 长沙 410128；湘西州水产工作站 吉首 416000;福建省水产研究所 厦门 361013 |
| 摘 要： | 本研究采用MISA软件分析泥东风螺(Babylonia lutosa)转录组中微卫星信息。结果显示，从转录组中共获得16324个SSR，共有181种重复基元；泥东风螺转录组中不同类型微卫星的重复基元具有不同的分布特征，其中，二核苷酸重复基元中AC/GT(70.58%)重复基元以重复6次出现频率占优；长度为12~20 bp的SSR占63.95%，长度为21~25 bp的SSR占9.14%，总体的平均长度为18.4 bp。随机选取其中50条序列设计引物，通过对福建野生泥东风螺群体(WP)DNA样本进行PCR扩增和分型，结果获得23个多态性位点，等位基因数目为2~7个不等，期望杂合度(Ne)为0.190~0.937，观察杂合度(No)为0.065~0.936，多态性信息含量(PIC)为0.061~0.777，有4个位点显著偏离哈迪温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium, HWE) (P<0.05)。对野生群体和养殖群体(BP)遗传多样性分析显示，野生群体和养殖群体的平均Ne分别为0.491和0.544，平均No分别为0.477和0.564，平均PIC分别为0.541和0.407。Fis结果显示，野生群体和养殖群体分别有13个和9个位点杂合子过剩。群体间遗传分化指数(Fst)为0.001~0.655，平均值为0.053 (0.05 |
| 关 键 词： | 泥东风螺 转录组 EST-SSR 遗传多样性 |
| 收稿时间： | 2019/4/17 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2019/5/12 0:00:00 |
Development and Genetic Diversity Analysis of Babylonia lutosa with EST-SSR Markers |
|
| Authors: | XIONG Gang WANG Xiaoqing WANG Pei CHEN Zhennian ZHOU Xianwen KANG Li ZENG Zhinan |
| Institution: | Department of Animal Science and Technology, Hunan Biological and Electromechanical Polytechnic, Changsha 410127; College of Animal Science and Technology, Hunan Agriculture University, Changsha 410128;College of Animal Science and Technology, Hunan Agriculture University, Changsha 410128; Station of Aquaculture in Xiang xi, Jishou 416000; Fisheries Research Institute of Fujian, Xiamen 361013 |
| Abstract: | |
| Keywords: | |
| 点击此处可从《》浏览原始摘要信息 | |
| 点击此处可从《》下载免费的PDF全文 | |