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玉米昼夜节律钟基因CCA1的克隆及表达分析
引用本文:邢国芳,杜伟建,张雁明,韩浩坤,韩渊怀. 玉米昼夜节律钟基因CCA1的克隆及表达分析[J]. 山西农业大学学报(自然科学版), 2011, 31(4): 332-337
作者姓名:邢国芳  杜伟建  张雁明  韩浩坤  韩渊怀
作者单位:1. 山西农业大学农学院,山西太谷030801;山西农业大学生物工程研究所,山西太谷030801
2. 山西农业大学农学院,山西太谷,030801
基金项目:山西农业大学科技创新基金
摘    要:昼夜节律钟基因CCA1在调解水稻和拟南芥的光周期反应中起着重要作用。本研究利用从水稻和拟南芥中分离到的CCA1基因序列作为靶序列BLAST获取Genbank中的信息,通过RT-PCR方法克隆获得了一条2326bp的玉米CCA1基因cDNA序列。BLAST比对发现其与水稻、大麦和拟南芥的序列相似性分别达73.7%、69.4%和39.8%。利用NCBI中的ORF Finder软件分析,发现该序列包含一个2163bp的开放阅读框,编码720个氨基酸残基,蛋白的分子量约为78819.17Da,等电点为6.468。推测其含有3个myb-DNA结合域、7个N-豆蔻酰化位点、1个G-box蛋白结合域以及1个蛋白跨膜结合域。采用实时荧光定量PCR分析发现,随光照时间的变化,该基因在玉米叶片中的表达量呈现出白天不断降低而夜晚逐渐升高的昼夜变化趋势。本研究为进一步研究玉米CCA1基因在调控玉米光周期敏感现象中的功能,阐明玉米光周期敏感机制提供了科学依据。

关 键 词:光周期  基因克隆  基因表达  玉米CCA1

Cloning and Expression Analysis of Circadian Clock Gene CCA1 in Maize
XING Guo-fang,DU Wei-jian,ZHANG Yan-ming,HAN Hao-kun,HAN Yuan-huai. Cloning and Expression Analysis of Circadian Clock Gene CCA1 in Maize[J]. Journal of Shanxi Agricultural University(Nature Science Edition), 2011, 31(4): 332-337
Authors:XING Guo-fang  DU Wei-jian  ZHANG Yan-ming  HAN Hao-kun  HAN Yuan-huai
Affiliation:XING Guo-fang1,2,DU Wei-jian1,ZHANG Yan-ming1,HAN Hao-kun1,HAN Yuan-huai1,2(1.College of Agriculture,Shanxi Agricultural University,Taigu Shanxi 030801,China,2.Agricultural Bioengineering Center,Taigu Shanxi 030801)
Abstract:CCA1 gene plays an important role in circadian clock sensitivity in rice(Oryza sative L.) and Arabidopsis thaliana.In this study,CCA1(2326 bp) was cloned by RT-PCR using homological primers based on the highly conserved region of the multiple alignment of the rice and Arabidopsis.CCA1 from GenBank of NCBI.The similarities of these sequences were up to 73.7%,69.4 and 39.8%,respectively,to corresponding mRNA sequences of rice,barley and Arabidopsis in BLAST/nr of GenBank database.Using ORF Finder software,a 2...
Keywords:Photoperiod  Gene cloning  Gene Expression  Maize CCA1  
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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