| 牛Meg8基因5'末端的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 侯晓慧,苏红,李世杰.牛Meg8基因5'末端的克隆及生物信息学分析[J].河北农业大学学报,2011,34(4). |
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| 作者姓名： | 侯晓慧 苏红 李世杰 |
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| 作者单位： | 河北农业大学生命科学学院,河北保定,071001 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，河北省自然科学基金 |
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| 摘 要： | 利用RACE方法从奶牛中克隆得到了Meg8基因的5 '端cDNA序列(GenBank登录号:HQ407410～HQ407413),序列比对发现该基因存在4种可变剪接体.选取牛Meg8基因的5'侧翼区作为研究对象,生物信息学在线分析发现:在人、绵羊、鼠、猪、狗和马这几个物种中,牛Meg8基因5'侧翼区与绵羊相似性最高,为80.45%；该区域内存在2个SINEs、1个Simple repeat,未发现CpG岛；可能存在2个启动子位点,位于牛Meg8基因的Exon1前3 402～4 118 bp和1 200～1 367 bp处,并富含Sp1、SRY、CdxA、GATA-1、MZF1等多个潜在的转录因子位点.Meg8基因5'侧翼区密集存在的转录因子可能与基因的转录起始有关.可变剪接体及侧翼区域的诸多转录因子可能是Meg8基因行使调控功能的原因,本研究结果将为阐明该基因的功能及其调控机理提供分子基础.
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| 关 键 词： | 牛 Meg8基因 5'RACE 可变剪接 启动子 转录因子结合位点 |
Cloning and bioinformatics analysis of the 5'-end of the Meg8 gene in cattle |
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| HOU Xiao-hui,SU Hong,LI Shi-jie.Cloning and bioinformatics analysis of the 5'-end of the Meg8 gene in cattle[J].Journal of Agricultural University of Hebei,2011,34(4). |
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| Authors: | HOU Xiao-hui SU Hong LI Shi-jie |
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| Abstract: | |
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