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鲢腐败希瓦氏菌株的16S rRNA鉴定
摘    要:从患病鲢(Hypophthalmichthys molitrix)体表分离获得1株革兰氏阴性细菌,菌株编号为BD1-5,通过细菌形态学观察、革兰氏染色镜检、16S r RNA序列分析以及构建系统发育树分析等进行鉴定研究。结果表明,患病白鲢体表皮肤溃烂,尤其尾部溃烂严重;对该病例主要组织进行镜检未见明显寄生虫;分子生物学检测结果显示鲤春病毒血症病毒(Spring viremia of carp virus, SVCV)、鲤疱疹病毒Ⅱ型(Cyprinid herpesvirus Ⅱ, Cy HV-Ⅱ)和锦鲤疱疹病毒(Koi herpesvirus, KHV)均为阴性;采用PCR方法获得该分离菌株16S r RNA序列片段大小为1 416 bp,与Shewanella putrefaciens(Gen Bank NO.:KX185698)序列相似性为99.72%;构建系统发育树分析显示,该菌株与Shewanella putrefaciens(Gen Bank NO.:KY817253)等自然聚为一枝。综合菌株形态及16S r RNA序列分析,最终推测该分离株为腐败希瓦氏菌(S. putrefaciens),属于革兰氏阴性杆菌。研究结果为证明腐败希瓦氏菌(S. putrefaciens)是鲢养殖过程中一种潜在致病源提供理论依据和参考。

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