| 基于rDNA ITS序列研究蚌科6种类的系统发生关系 |
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| 引用本文： | 许志强,葛家春,李晓晖,霍光明,潘建林. 基于rDNA ITS序列研究蚌科6种类的系统发生关系[J]. 淡水渔业, 2009, 39(1) |
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| 作者姓名： | 许志强 葛家春 李晓晖 霍光明 潘建林 |
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| 作者单位： | 江苏省淡水水产研究所,南京,210017;南京师范大学生命科学学院,南京,210097;南京晓庄学院生命科学系,南京,211171 |
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| 基金项目： | 江苏省淡水珍珠蚌种质资源保护与利用项目，江苏省科技厅公益研究与服务专项基金 |
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| 摘 要： | 通过测定核糖体转录间隔区ITS1以及ITS2序列研究了江苏地区蚌科(Unionidae)6种常见贝类——褶纹冠蚌(Cristaria plicata)、三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)、背角无齿蚌(Anodneta woodiana woodiana)、扭蚌(Arconaialanceolata)、圆顶珠蚌(Unio douglasiae)以及背瘤丽蚌(Lamprotula leai)的系统发生关系。结果显示:6种蚌的ITS1序列长度介于354~439 bp之间,平均G+C百分含量为52.7%;ITS2序列长度介于287~354 bp之间,平均G+C百分含量为51.2%。对6种贝类的相关序列进行比对,ITS1的比对长度包括501个位点,其中有364个变异位点和99个简约信息位点;ITS2的比对长度包括381个位点,其中有259个变异位点和66个简约信息位点。以虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)为外群,采用邻接法(NJ)分析6种贝类的系统发生关系,贝类明显聚合为3个类群:类群Ⅰ包括三角帆蚌(H.culingii)和背瘤丽蚌(L.leai),类群Ⅱ包括扭蚌(A.lanceolata)和圆顶珠蚌(U.douglasiae),类群Ⅲ由背角无齿蚌(A.woodiana woodiana)和褶纹冠蚌(C.plicata)组成。
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| 关 键 词： | 蚌科 核糖体转录间隔区 系统发生 |
The Phylogenetic Analysis of 6 Bivalvia Species(Unionidae)Based on the Sequences of Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer |
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| XU Zhi-qiang,GE Jia-chun,LI Xiao-hui,HUO Guang-ming,PAN Jian-lin. The Phylogenetic Analysis of 6 Bivalvia Species(Unionidae)Based on the Sequences of Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer[J]. Freshwater Fisheries, 2009, 39(1) |
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| Authors: | XU Zhi-qiang GE Jia-chun LI Xiao-hui HUO Guang-ming PAN Jian-lin |
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| Affiliation: | XU Zhi-qiang1,GE Jia-chun1,LI Xiao-hui2,HUO Guang-ming3,PAN Jian-lin1(1.Freshwater Fishery Research Institute of Jiangsu Province,Nanjing 210017,2.School of Life Science,Nanjing Normal University,Nanjing 210093,3.School of Life Science,Nanjing Xiaozhuang University,Nanjing 211171) |
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| Abstract: | This study presents the ribosomal DNA internal transcribed spacer region sequences(ITS1 and ITS2)of 6 bivalvia species(Unionidae: Cristaria plicata;Hyriopsis cumingii;Anodneta woodiana woodiana;Arconaia lanceolata;Unio douglasiae and Lamprotula leai)which were all collected from Jiangsu Province.The length of ITS1 ranges from 354 bp to 439 bp,with average G+C content of 52.7%.The length of ITS2 ranges from 287 bp to 354 bp,with average G+C content of 51.2%.The alignment length of the ITS1 sequence is 501,in... |
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| Keywords: | Unionidae ribosomal DNA internal transcribed spacer phylogeny |
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