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42个杂交粳稻亲本SSR指纹图谱的构建及遗传多样性分析
引用本文:刘海珍,李莉,滕斌,从夕汉,陆徐忠,倪大虎,宋丰顺,汪秀峰,杨剑波.42个杂交粳稻亲本SSR指纹图谱的构建及遗传多样性分析[J].安徽农业科学,2009,37(10):4420-4423.
作者姓名:刘海珍  李莉  滕斌  从夕汉  陆徐忠  倪大虎  宋丰顺  汪秀峰  杨剑波
作者单位:安徽农业大学农学院,安徽合肥,230036;安徽农业科学院水稻所生物技术室,安徽合肥,230031;安徽农业科学院水稻所生物技术室,安徽合肥,230031
基金项目:国家科技支撑计划(2006BAD13B01)
摘    要:目的]研究利用SSR技术构建以杂交粳稻亲本为主的SSR指纹图谱。方法]用48对SSR引物扩增了42个杂交粳稻亲本的基因组DNA,从中筛选出12对具有稳定多态性的引物,推荐为核心引物。建立了42个杂交粳稻亲本×12个核心引物的DNA指纹数据库。结果]采用类平均法聚类分析计算42个基因型的相似系数,在相似系数0.73处,可将42个杂交粳稻亲本分为5大类。结论]聚类分析的结果基本反映了品种间的亲缘关系。

关 键 词:杂交粳稻  微卫星标记  指纹图谱  遗传相似性

Establishemnt of SSR Fingerprint Map and Analysis of Genetic Similarity among 42 Parents of Japonica Hybrid Rice
LIU Hai-zhen et al.Establishemnt of SSR Fingerprint Map and Analysis of Genetic Similarity among 42 Parents of Japonica Hybrid Rice[J].Journal of Anhui Agricultural Sciences,2009,37(10):4420-4423.
Authors:LIU Hai-zhen
Institution:LIU Hai-zhen et al(Agricultural College,Anhui Agricultural University,Hefei,Anhui 230036)
Abstract:Objective] The study aims to research SSR method establishing the SSR fingerprinting map of parents of japonica hybrid rice.Method] The genomic DNA of 42 parents of japonica hybird rice is used for PCR analysis with 48 pairs of SSR primers,of which 12 primers are selected as core primers because of their stable polymorphism.A database of SSR fingerprint for 42 genotypes at the 12 primer loci is constructed.Result] The genetic similarity of 42 genotypes is calculated by cluster analysis of an un-weighted ...
Keywords:Japonica hybrid rice  Microsatellite markers  Fingerprinting map  Genetic similarity  
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