三叶木通果实转录组测序初步分析 |
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引用本文: | 杨航,刘红昌,石小兵,葛菲,赵致,罗辉.三叶木通果实转录组测序初步分析[J].贵州大学学报(农业与生物科学版),2016(2):46-51. |
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作者姓名: | 杨航 刘红昌 石小兵 葛菲 赵致 罗辉 |
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作者单位: | 1. 贵州大学 生命科学学院,贵州 贵阳,550025;2. 贵州大学 农学院,贵州 贵阳,550025;3. 贵州省林业厅推广总站,贵州 贵阳,550001 |
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基金项目: | 贵州省科技厅项目"木通仿生栽培研究与应用示范"(黔科合SY字[2014] 3034-1号),贵州省科技厅项目"贵州省林业厅青年人才基金项目"(黔林科合J字[2014] 08号),贵州省科技厅项目"贵州省药用植物繁育与种植人才基地"(黔人领发(2013)15号) |
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摘 要: | 为了探究三叶木通果实成熟过程中基因表达情况,本实验采用Illumina HiSeq2000高通量测序技术对三叶木通6个不同时期果实进行了转录组测序,对所获得的数据进行GO和KOG注释与分类及KEGG代谢通路分析。本实验共获得Unigene 106 547条,在GO与KOG数据库中分别有27 302和12 014条Unigene注释成功,KEGG通路分析显示有11 749个Unigene参与到270条已知代谢通路中,其中包括26条乙烯合成关键酶的Unigene。本实验结果可为探究三叶木通果实成熟过程中基因表达情况以及三叶木通果实成熟基因的后续研究提供重要基础。
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关 键 词: | 三叶木通 果实 转录组 |
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