中国部分省份苹果轮纹病菌及相关类群的系统学关系

【目的】对苹果轮纹病菌（Botryosphaeria dothidea）及其相关类群的rDNA-ITS序列进行分析,探讨他们之间的系统学关系,为进一步研究其系统发育和演化提供理论依据。【方法】对来源于陕西、山西、山东、河南及四川5个省份的113株苹果轮纹病菌和2株梨轮纹病菌的rDNA-ITS区段直接测序,经GenBank同源性检索比对（BLASTn）及DnaSP 4.0软件分析后,结合GenBank下载序列构建系统发育的邻接树和最大简约树,同时计算遗传距离和序列核苷酸差异数。【结果】115株供试菌株分为9个单倍型（Hap₁～Hap₉）,其中Hap₇（B.obtusa）来源于山西省;Hap₉（苹果壳色单隔孢溃疡病菌,B.stevensii）来源于四川省;其余单倍型均为B.dothidea,其中Hap₁的出现频率最高,包含86株分离株。邻接法和最大简约法分析结果显示,用于构建发育树的序列均形成了3个大的聚类组。聚类组Ⅰ包含B.obtusa、B.rhodina（柑橘葡萄座腔菌）和B.stevensii等3个种,其中B.obtusa和B.rhodina各自独立聚为一支,而B.stevensii全部序列分为3支。聚类组Ⅱ包含2个分支:其中B.lutea单独聚为一支;B.ribis（茶麃子葡萄座腔菌）和B.parva亲缘关系较近,共同聚为一支。聚类组Ⅲ由B.dothidea和贝伦格葡萄座腔菌（B.berengeriana）共同构成,支持B.dothidea与B.berengeriana为同物异名的观点。遗传距离及序列核苷酸差异数显示,B.dothidea与其他种间的遗传距离在4.91%～7.57%,序列核苷酸差异数为31～54bp;B.dothidea不同单倍型之间的遗传距离为0.19%～1.93%,序列核苷酸差异数为1～10bp。【结论】B.stevensii显示出了复合种的特性,其分类地位还有待于进一步研究。B.dothidea与其他相似种的亲缘关系较远,且在B.dothidea种内存在核苷酸序列的分化,但分化程度较低。B.dothidea不同地理来源的菌株之间存在差异,但地理分化特征不明显。

Phylogenetic relationships of Botryosphaeria dothidea and its allies in China