| 适合转录组测序的芒果不同组织RNA试剂盒提取方法研究 |
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| 引用本文： | 张宇,黄国弟,莫永龙,龙凌云,张继,唐玉娟. 适合转录组测序的芒果不同组织RNA试剂盒提取方法研究[J]. 经济林研究, 2019, 37(1): 32-36 |
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| 作者姓名： | 张宇 黄国弟 莫永龙 龙凌云 张继 唐玉娟 |
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| 作者单位： | 广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西 南宁,530001;广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西 南宁,530001;广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西 南宁,530001;广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西 南宁,530001;广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西 南宁,530001;广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西 南宁,530001 |
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| 基金项目： | 广西自然科学基金;广西自然科学基金;基本科研业务费项目;现代农业产业技术体系建设专项广西创新团队项目;农业部农垦局热作技术试验示范与服务支持项目 |
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| 摘 要： | ![]()
为了探寻能够满足芒果各组织转录组测序要求的高质量RNA提取方法,以‘桂热芒82号’的叶片、花和果实为材料,从RNA提取质量和产率、琼脂糖电泳和RT-PCR结果分析、RNA测序质量评价这3个方面,对常用的3种试剂盒的提取效果进行了实验研究和评价分析。结果表明:以来自于天根生化科技有限公司的DP 419试剂盒提取的芒果各组织的RNA质量均较好,提取的RNA产率远高于其余两种试剂盒的提取产率;除以美伯生物医药技术有限公司的RM 103试剂盒提取芒果各组织所得RNA,经琼脂糖电泳未见有5S条带出现外,以其余两种试剂盒提取的芒果各组织的RNA都存在28S、18S、5S条带且RT-PCR分析结果理想;对以3种试剂盒提取所得的RNA进行完全测序,结果表明,3种试剂盒提取的RNA完全测序都大于98.99%,能满足RNA-Seq分析的要求。文中综合上述评判因素分析认为,天根生化科技有限公司的DP 419试剂盒是适用于芒果叶片、花和果实RNA提取的最优试剂盒。
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| 关 键 词： | 芒果 RNA 试剂盒 测序 |
Study on kits extraction methods of RNA suitable for transcriptome sequencing from different tissues in Mangifera indica |
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| ZHANG Yu,HUANG Guodi,MO Yonglong,LONG Lingyun,ZHANG Ji,TANG Yujuan. Study on kits extraction methods of RNA suitable for transcriptome sequencing from different tissues in Mangifera indica[J]. Economic Forest Researches, 2019, 37(1): 32-36 |
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| Authors: | ZHANG Yu HUANG Guodi MO Yonglong LONG Lingyun ZHANG Ji TANG Yujuan |
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| Affiliation: | (Guangxi Subtropical Crops Research Institute,Nanning 530001,Guangxi,China) |
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| Abstract: | ![]()
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| Keywords: | Mangifera indica RNA kit sequencing |
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