花椰菜苗期黑腐病抗、感品种转录组差异表达分析 |
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引用本文: | 姚玉荣,霍建飞,郝永娟,贲海燕,王万立.花椰菜苗期黑腐病抗、感品种转录组差异表达分析[J].山东农业科学,2020,52(7). |
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作者姓名: | 姚玉荣 霍建飞 郝永娟 贲海燕 王万立 |
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作者单位: | 天津科润农业科技股份有限公司/蔬菜种质创新国家重点实验室,天津 300384;天津市植物保护研究所,天津 300384;天津科润农业科技股份有限公司/蔬菜种质创新国家重点实验室,天津 300384 |
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基金项目: | 国家重点实验室开放基金;天津市自然科学基金 |
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摘 要: | 为研究花椰菜抗黑腐病的分子机制,本试验利用Illumina测序平台的RNA-Seq技术对花椰菜黑腐病感病品种Y1-2和抗病品种EC-247接种黑腐病菌5 d后的样本进行高通量转录组分析,采用RSEM软件计算基因表达量,并在此基础上筛选两组样本间的差异表达基因。结果显示,抗、感品种间差异表达基因共3 195个,其中上调表达基因1 424个,下调表达基因1 771个。通过GO和KEGG进行基因功能显著性富集分析发现,差异表达基因主要富集于苯丙烷类代谢、次级代谢产物合成、逆境响应、MAPK信号通路等途径。本研究结果可为解析花椰菜与黑腐病互作机制、挖掘黑腐病抗病基因提供参考。
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关 键 词: | 花椰菜 黑腐病 转录组 差异表达基因 |
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