| 日本沼虾不同亚型维甲酸类X受体(RXR)cDNA克隆及序列分析 |
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| 引用本文： | 王文青,朱小玲. 日本沼虾不同亚型维甲酸类X受体(RXR)cDNA克隆及序列分析[J]. 淡水渔业, 2010, 40(1) |
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| 作者姓名： | 王文青 朱小玲 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306;上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306 |
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| 基金项目： | 校研究生科研基金(A-2501-08-165,科07-271-134) |
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| 摘 要： | 采用RT-PCR和RACE末端扩增技术,从日本沼虾(Macrobrachium nipponense)卵巢组织中获得了5种不同构型的RXR基因cDNA序列。结果显示:RXR基因中MnRXRL2含有最长的开放阅读框(open reading frame,ORF),其全长1698 bp,编码337个氨基酸。对比5个不同构型的核苷酸序列,有四个不同的剪接位点,一个发生在5′端A/B区域,产生了3种不同形式的5′端序列;一个在RXR受体结构的D区即铰链区域,使T-盒区长度也有3种形式(VQEERQR/VQVGGIEEERQR/VQVGGIE);两个发生在LBD区,其中一个是在H2-H3螺旋区域,产生了2种不同形式(MnRXRL/MnRXRS),另外一个是在D区产生了中断,缺失了E/F区域(MnRXRM)。将各个序列编码的氨基酸序列与其他物种相比,与甲壳类的同源性较高,表明RXR在进化中较为保守。
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| 关 键 词： | 日本沼虾(Macrobrachium nipponense) RXR受体 克隆 cDNA序列 |
cDNA Cloning and sequence analysis of retinoid X receptor (RXR) isoforms of the prawn (Macrobrachium nipponense) |
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| WANG Wen-qing,ZHU Xiao-ling. cDNA Cloning and sequence analysis of retinoid X receptor (RXR) isoforms of the prawn (Macrobrachium nipponense)[J]. Freshwater Fisheries, 2010, 40(1) |
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| Authors: | WANG Wen-qing ZHU Xiao-ling |
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| Affiliation: | College of Life Science and Technology;Shanghai Ocean University;Shanghai 201306 |
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| Abstract: | RT-PCR and RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends) methods were used for the isolation of the RXR from the ovary of Macrobrachium nipponense.Five different RXR isforms were obtained,including the MnRXRL2 isoform(1698 bp) with the longest open reading frame encoding 337 amino acids.Through comparing of the five nucleotide sequences,it is found that there are four alternative splicing sites among the five variant sequences,one in the A/B domain resulting in three different kinds of sequences,one in the T box i... |
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| Keywords: | prawn(Macrobrachium nipponense) retinoic X receptor cloning cDNA sequence |
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