| 水稻OsURGT1基因的生物信息学及表达谱分析 |
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| 作者姓名： | 苏莹 杜强 郭崇炎 周敏 石伟杰 赵琼 吴小雨 王志龙 陈秋红 |
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| 作者单位： | 湖南农业大学 农学院,水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室,作物基因工程湖南省重点实验室,湖南 长沙 410128,湖南农业大学 农学院,水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室,作物基因工程湖南省重点实验室,湖南 长沙 410128,赣州市花卉研究所,江西 赣州 341413,湖南农业大学 农学院,水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室,作物基因工程湖南省重点实验室,湖南 长沙 410128,湖南农业大学 农学院,水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室,作物基因工程湖南省重点实验室,湖南 长沙 410128,湖南农业大学 农学院,水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室,作物基因工程湖南省重点实验室,湖南 长沙 410128,湖南农业大学 农学院,水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室,作物基因工程湖南省重点实验室,湖南 长沙 410128,湖南农业大学 农学院,水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室,作物基因工程湖南省重点实验室,湖南 长沙 410128,湖南农业大学 农学院,水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室,作物基因工程湖南省重点实验室,湖南 长沙 410128 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;湖南省教育厅科学研究项目;湖南省自然科学基金 |
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| 摘 要： | NSTs在细胞中负责将核苷酸单糖转运到高尔基体(Golgi)/内质网(ER)中,为细胞壁多糖分子的生物合成提供底物,水稻NSTs基因的研究将为深入了解植物NSTs蛋白的功能奠定良好基础。通过拟南芥AtURGT基因序列的同源比对,在水稻中发现了一个可能具有转运UDP-鼠李糖/UDP-半乳糖活性的基因,命名为OsURGT1(UDP-L-Rha/UDP-D-Gal transporters)。对其编码蛋白进行了氨基酸组成、进化关系、理化性质、跨膜结构域和高级结构的预测,对其启动子序列进行了顺式作用元件分析,同时还检测并分析了OsURGT1基因在水稻中的组织转录表达谱、激素及非生物胁迫处理诱导表达谱。结果显示:OsURGT1基因全长为3 421 bp,含有5个外显子;CDS全长为996 bp,编码331个氨基酸长度的蛋白,此蛋白被预测是一个疏水性蛋白,含有9个跨膜结构域;蛋白高级结构建模结果表明,其与一个NST模板蛋白高度相似。基因启动子顺式作用元件分析结果表明,OsURGT1基因有可能参与多种激素调控途径和逆境胁迫调控途径。转录表达谱分析结果表明,...
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| 关 键 词： | 水稻 TPT/NST家族 核苷酸单糖 生物信息学分析 逆境胁迫 表达谱分析 |
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