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烟草EST数据库构建及cDNA阵列技术建立
引用本文:李文正,宋利民,李永平,卢秀萍,骆红梅,戴承恩,方永启,董海涛,李德葆.烟草EST数据库构建及cDNA阵列技术建立[J].农业生物技术学报,2008,16(4).
作者姓名:李文正  宋利民  李永平  卢秀萍  骆红梅  戴承恩  方永启  董海涛  李德葆
作者单位:1. 云南省烟草科学研究所,玉溪,653100
2. 杭州师范大学生命与环境科学学院,杭州,310036
3. 浙江大学生物技术研究所,杭州,310029
基金项目:云南省烟草专卖局(公司)资助项目,国家自然科学基金
摘    要:一组容量为5 927条烟草(Nicofiana tabacum)EST的数据(GenBank登录号为CV015900~CV021826),包含521个重叠群和3 079个独立EST.EST数据分析显示:高丰度表达基因主要涉及光合代谢、蛋白合成等植物基本的生理功能;而低丰度表达基因则占假定独立转录本(TUTs)总数的85.5%.在此基础上,制备完成cDNA阵列,并应用于盐胁迫下烟叶的基因表达谱分析,结果表明,盐胁迫即可使烟草叶片的基因表达谱发生显著改变,并涉及多个重要的植物生理过程.包括水通道蛋白PIP2a、乙烯应答蛋白酶和mRNA剪接因子prp31等42个基因的检出,为阐明植物胁迫反应的调控机制提供新的线索.

关 键 词:烟草  表达序列标签  cDNA阵列  实时定量PCR

Construction of EST Data Base and Establishment of cDNA Array
LI Wen-zheng,SONG Li-min,LI Yong-ping,LU Xiu-ping,LUO Hong-mei,DAI Chen-gen,FANG Yong-qi,Dong Hai-tao,LI De-bao.Construction of EST Data Base and Establishment of cDNA Array[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2008,16(4).
Authors:LI Wen-zheng  SONG Li-min  LI Yong-ping  LU Xiu-ping  LUO Hong-mei  DAI Chen-gen  FANG Yong-qi  Dong Hai-tao  LI De-bao
Abstract:
Keywords:
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