| 猪圆环病毒3型全基因克隆及遗传演化分析 |
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| 引用本文： | 金宏凯,马宇驰,孙莉,樊琼,董媛媛,马鸣潇.猪圆环病毒3型全基因克隆及遗传演化分析[J].畜牧与兽医,2019(2):70-75. |
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| 作者姓名： | 金宏凯 马宇驰 孙莉 樊琼 董媛媛 马鸣潇 |
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| 作者单位： | 锦州医科大学畜牧兽医学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31372435);"辽宁特聘教授"项目 |
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| 摘 要： | 辽宁地区某猪场发现疑似断奶仔猪多系统综合征(PMWS),经临床症状、病理变化和PCR检测,确诊为猪圆环病毒3型(PCV3)感染;根据Gen Bank中收录的PCV3基因序列,设计2对特异性引物,从患有PMWS的仔猪内脏组织中扩增PCV3全基因序列,克隆到p MD18-T载体中,经测序、拼接获得PCV3全长c DNA序列,利用DNAStar和DNAman生物软件对全基因组进行遗传变异分析。结果显示:PCV3毒株基因组全长2 000 bp,命名为CN/Liaoning-2017 (简称LN株)(GenBank登录号:MH177453. 1),基因组有3个开放阅读框(ORF),其中2个ORF编码的蛋白与圆环病毒的复制相关蛋白(Rep)和衣壳蛋白(Cap)同源。Cap基因大小为645 bp,编码214个氨基酸。PCV3国内株可分为3大分支(3a簇、3b簇与3c簇),LN株处于3a簇分支中,与湖北株(KY354039. 1)同源性最高,达到99. 7%; LN株与PCV3a簇代表株(PCV3-USMN2016,PCV3-US-MO2015)同源性在98. 8%～99. 2%之间,与PCV3b簇代表株(PCV3-US-SD2016)的同源性为98. 8%,与PCV3c簇代表株(PCV3-China-GD-2016)同源性为98. 7%。Cap蛋白氨基酸位点分析显示,LN株在第68位发生突变,与其他代表株都不相同。以上试验结果表明,成功从患有PMWS的仔猪体内克隆了PCV3全基因,并完成了序列分析。LN株是辽宁省首次发现的PCV3毒株,这些数据将为研究PCV3的遗传变异和流行病学特征提供分子生物学依据。
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| 关 键 词： | 猪圆环病毒3型 全基因组 克隆 遗传演化 |
Cloning and genetic evolution analysis of whole genome of porcine circovirus type 3 |
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| JIN Hongkai,MA Yuchi,SUN Li,FAN Qiong,DONG Yuanyuan,MA Mingxiao.Cloning and genetic evolution analysis of whole genome of porcine circovirus type 3[J].Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2019(2):70-75. |
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| Authors: | JIN Hongkai MA Yuchi SUN Li FAN Qiong DONG Yuanyuan MA Mingxiao |
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| Institution: | (College of Animal Husbandry and Veterinary Medicine,Jinzhou Medical University,Jinzhou 121000,China) |
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| Abstract: | JIN Hongkai;MA Yuchi;SUN Li;FAN Qiong;DONG Yuanyuan;MA Mingxiao(College of Animal Husbandry and Veterinary Medicine,Jinzhou Medical University,Jinzhou 121000,China) |
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| Keywords: | porcine circovirus type 3 whole genome cloning genetic evolution analysis |
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