| 牦牛不同年龄肌肉组织microRNA表达谱及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 纪会,王会,柴志欣,王吉坤,王嘉博,罗晓林,姬秋梅,信金伟,钟金城.牦牛不同年龄肌肉组织microRNA表达谱及生物信息学分析[J].畜牧兽医学报,2019(5):957-971. |
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| 作者姓名： | 纪会 王会 柴志欣 王吉坤 王嘉博 罗晓林 姬秋梅 信金伟 钟金城 |
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| 作者单位： | 西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室;四川省草原科学研究院;西藏自治区农牧科学院省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室 |
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| 基金项目： | 西南民族大学研究生创新型科研项目(CX2018SZ113);国家肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37) |
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| 摘 要： | 旨在挖掘牦牛不同年龄肌肉组织中miRNA表达谱,分析其生物学特征,以探索其在牦牛肌肉发育过程中的调节模式。本研究构建0.5、2.5、4.5和7.5岁肌肉组织的4个小RNA文库,利用Solexa技术进行测序,用生物信息学方法和RT-qPCR技术对测序结果进行分析和验证。结果,获得各miRNAs分别在4个年龄段肌肉组织中的表达量,在7.5岁肌肉组织中发现58个共同与0.5、2.5、4.5岁差异表达的miRNAs,其中53个miRNAs在7.5岁肌肉组织中显著下调,5个显著上调。运用R语言进行GO富集和KEGG信号通路分析,58个miRNAs可能通过PI3K-Akt、MAPK、Ras和肌动蛋白细胞骨架调节通路(regulation of actin cytoskeleton)参与调节牦牛肌肉细胞的增殖与分化,且PI3K-Akt、MAPK、Ras 3个信号通路共同靶向53个靶基因,说明3个信号通路相互关联。随机选择8个miRNAs进行RT-qPCR验证,结果表明其中7个miRNAs的表达趋势与测序结果一致。结果表明,牦牛肌肉发育可能受到多种miRNA的调控并涉及多个信号通路,有助于构建肌肉组织中miRNA的调控网络,为进一步研究miRNA调控哺乳动物肌肉发育奠定了理论基础。
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| 关 键 词： | 牦牛 肌肉组织 高通量测序 miRNA |
Differential Expression Profile and Bioinformatics Analysis of miRNAs in Yak Muscle Tissue during Development |
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| JI Hui,WANG Hui,CHAI Zhixin,WANG Jikun,WANG Jiabo,LUO Xiaolin,JI Qiumei,XIN Jinwei,ZHONG Jincheng.Differential Expression Profile and Bioinformatics Analysis of miRNAs in Yak Muscle Tissue during Development[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2019(5):957-971. |
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| Authors: | JI Hui WANG Hui CHAI Zhixin WANG Jikun WANG Jiabo LUO Xiaolin JI Qiumei XIN Jinwei ZHONG Jincheng |
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| Institution: | (Key Laboratory of the Qinghai-Tibet Plateau Animal Genetic Resources Protection and Utilization of the Ministry of Education,Southwest Minzu University,Chengdu 610041,China;Sichuan Academy of Grassland Sciences,Chengdu 611731,China;State Key Laboratory of Hulless Barley and Yak Germplasm Resources and Genetic Improvement,Tibet Academy of Agricultural and Animal Husbandry Sciences,Lhasa 850009,China) |
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| Abstract: | JI Hui;WANG Hui;CHAI Zhixin;WANG Jikun;WANG Jiabo;LUO Xiaolin;JI Qiumei;XIN Jinwei;ZHONG Jincheng(Key Laboratory of the Qinghai-Tibet Plateau Animal Genetic Resources Protection and Utilization of the Ministry of Education,Southwest Minzu University,Chengdu 610041,China;Sichuan Academy of Grassland Sciences,Chengdu 611731,China;State Key Laboratory of Hulless Barley and Yak Germplasm Resources and Genetic Improvement,Tibet Academy of Agricultural and Animal Husbandry Sciences,Lhasa 850009,China) |
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| Keywords: | yak muscle tissue high-throughput sequencing miRNA |
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