广东省大豆种质资源遗传多样性分析及DNA 分子身份证构建 |
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作者姓名: | 李清 罗永坚 吴柔贤 贾俊婷 张文虎 宋松泉 刘军 |
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作者单位: | 1. 广东省农业科学院农业生物基因研究中心/ 广东省农作物种质资源保存与利用重点实验室,广东 广州 510640;2. 湖北民族大学林学园艺学院,湖北 恩施 445000 |
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基金项目: | 广东省科技计划项目(2020B121201008,2020B020220008);广东省现代农业产业技术体系创新团队项目(2019KJ106);广州市科技计划项目(201909020001,201807010114) |
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摘 要: | 【目的】对广东省大豆资源进行遗传多样性分析,筛选有效的SSR 分子标记,以及构建快速鉴定的DNA 分子身份证。【方法】收集了广东省19 个市37 个县市共96 份大豆种质资源,提取基因组DNA 后,利用30 对SSR 引物进行PCR 扩增,通过测序检测获得相关多态性结果进行聚类分析以及DNA 分子身份证构建,记录相关品种性状并转化为可视化信息。【结果】毛细管电泳检测结果表明,30 对SSR 引物在96 份大豆材料之间均具有清晰稳定的多态性片段,共扩增出273 个多态性等位变异片段,平均每对引物扩增出多态性等位变异片段数14.29 个;不同引物揭示的多态性信息含量(PIC)的范围为0.3891~0.9310,平均值为0.6786,30 对引物可用于区分广东大豆资源。通过聚类分析发现,所收集的大豆样品可以分为3 个类群,具有遗传多样性。从PIC 最高者开始进行引物组合,筛选出6 对能将96 份大豆区分开的引物。【结论】基于6 对SSR 引物扩增结果,对多态性片段排序,通过数字与英文结合编码,成功构建96 份大豆资源的DNA 分子身份证,为广东省大豆种质资源鉴定提供了重要依据。
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关 键 词: | 大豆 SSR 遗传多样性 分子身份证 聚类分析 |
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