基于SNP分子标记的新疆野生黄花苜蓿遗传多样性分析

为揭示新疆野生黄花苜蓿的遗传多样性，研究利用SLAF-seq技术对材料进行SNP开发。结果显示，材料测序平均Q30值为96.32%，平均GC值为37.99%。研究共开发了376 641个SLAF标签，多态性SLAF标签119 331个；SNP平均完整性为24.77%，平均杂合率5.53%。供试新疆野生黄花苜蓿品系的有效等位基因数、观测等位基因数、期望杂合度、观测杂合度和Shnnon Wiener指数的平均值分别为1.380、1.594、0.220、0.117和0.327。研究表明，聚类分析将材料分为7类，PCA将材料分为3类，但样品的来源为同一个祖先。