| 毛竹EST资源SSR标记分析与筛选 |
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| 作者姓名： | 张智俊 管雨 杨丽 余利 罗淑萍 |
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| 作者单位： | 1. 亚热带森林培育国家重点实验室培育基地,浙江农林大学,浙江,临安,311300
2. 新疆农业大学农学院,乌鲁木齐,830052 |
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| 基金项目： | 国家‘863’计划项目,浙江省自然科学基金,浙江林学院人才启动基金、,重点实验室开放基金 |
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| 摘 要： | 对来源于NCBI公共数据库的非冗余3 087条毛竹（Phyllostachys edulis）EST序进行简单重复序列SSR搜索发现：在401条毛竹EST序列中共查找到408个SSR位点,平均6.8 kb EST序列中含有1个SSR。其中二核苷酸和三核苷酸重复是毛竹EST-SSR的主要重复类型,分别占SSR总数的43.14%和49.75%。SSR的不同重复基序中,最常见的重复基序是：(AG)n,占37.01%,其余出现频率较高的依次为(TC)n、(AGC)n、(GAG)n和(CGC)n。根据搜索结果设计了182条毛竹EST-SSR引物,以12个不同种属的竹子DNA为模板,对引物进行了稳定性、通用性的验证与评价。结果表明有42对引物有较清晰且稳定的目标扩增产物,其中39对引物的产物存在多态性,说明设计开发的毛竹的EST-SSR标记是可行且有效的。
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| 关 键 词： | 毛竹 EST-SSR 分子标记 |
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