| 谷子GATA基因家族的鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 卢成达,李 阳,孙 迪,牛学谦,昌秦湘.谷子GATA基因家族的鉴定及表达分析[J].西北农业学报,2021,30(5):645-654. |
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| 作者姓名： | 卢成达 李 阳 孙 迪 牛学谦 昌秦湘 |
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| 作者单位： | （1.山西农业大学 农学院，山西太谷 030801；2.太原学院 园林科学研究所，太原 030032） |
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| 基金项目： | 浙江省植物次生代谢与调控重点实验室开放基金（ZWCSDX-201901）；山西省重点研发计划(201803D221012-5)；山西省重点研发计划(201703D211002-4-2)；山西省深度贫困县科技精准扶贫专项（2019FP-12）。 |
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| 摘 要： | 本研究从谷子基因组水平鉴定出33个SiGATA成员,命名为 SiGATA1～ SiGATA33。利用生物信息学方法对谷子SiGATA家族的系统发育、基因结构、染色体分布、保守基序、蛋白三级结构和顺式调控元件进行预测和分析。结果表明,33个SiGATA转录因子被划分为3组,不均匀的分布在8条染色体上,多数含有CX_2CX_(18)CX_2C保守结构域;谷子GATA蛋白与单子叶植物水稻的同源性大于其他两种单子叶植物;蛋白三级结构分析表明,整体结构相似度存在差异,同组进化序列基因的结构相似度较高;顺式作用元件分析表明,SiGATAs启动子序列中存在调控生长发育、激素信号传导和逆境胁迫响应元件,其中 SiGATA15、 SiGATA22、 SiGATA31在干旱、厌氧诱导及脱落酸响应等元件中表达量较高,其在谷子生长发育及逆境响应过程中可能发挥了重要生物学功能。这些逆境响应及生长发育相关转录因子的挖掘,将为作物育种提供一定理论参考。
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| 关 键 词： | 谷子（Setaria italica） GATA 生物信息学 表达分析 |
Genome-wide Identification and Expression Analysis of GATA gene Family in Foxtail Millet |
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| LU Chengd,LI Yang,SUN Di,NIU Xueqian and CHANG Qinxiang.Genome-wide Identification and Expression Analysis of GATA gene Family in Foxtail Millet[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2021,30(5):645-654. |
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| Authors: | LU Chengd LI Yang SUN Di NIU Xueqian and CHANG Qinxiang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Foxtail millet(Setaria italica) GATA Bioinformatics Expression analysis |
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