火龙果HuABAR的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位 |
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引用本文: | 汤纬玮,王庆竹,李慧平,文晓鹏.火龙果HuABAR的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位[J].华中农业大学学报,2018,37(5):18-24. |
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作者姓名: | 汤纬玮 王庆竹 李慧平 文晓鹏 |
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作者单位: | 贵州大学农业生物工程研究院/生命科学学院/山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31760566) |
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摘 要: | 在前期利用SSH筛选到抗旱相关基因HuABAR的Unigene序列的基础上,进行了HuABAR的全长cDNA克隆、生物信息学分析及亚细胞定位。结果表明:HuABAR基因cDNA全长为1 239bp,5′-UTR为264bp,3′-UTR为414bp,完整开放阅读框(ORF)共561bp,编码187个氨基酸;生物信息学分析显示,HuABAR基因编码蛋白具有典型的SRPBCC结构域,并与PYR1/PYLs(pyrabactin resistance 1/PYR1like)家族具有较高的相似性;HuABAR在干旱、高温(42℃)和低温(4℃)等逆境胁迫下显著上调表达,并在干旱胁迫5d、高温3d时表达量最高,低温处理5d内,表达量持续上升;通过PEG介导法瞬时转化拟南芥原生质体进行亚细胞定位分析,发现该基因定位于细胞质,与已报道的其他PYR1/PYLs家族基因一致。因此,HuABAR基因可能在火龙果干旱胁迫应答中发挥重要作用。
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关 键 词: | 火龙果 非生物胁迫 脱落酸受体基因 生物信息学分析 亚细胞定位 |
收稿时间: | 2018/5/7 0:00:00 |
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