缩骨鲫Cyt b基因和控制区序列克隆及系统进化分析 |
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引用本文: | 李强,郑鹏,黄文炜,彭苏汉,周江伟,詹华伟,蓝昭军,桂林.缩骨鲫Cyt b基因和控制区序列克隆及系统进化分析[J].湖南农业科学,2023(10):7-10+25. |
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作者姓名: | 李强 郑鹏 黄文炜 彭苏汉 周江伟 詹华伟 蓝昭军 桂林 |
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作者单位: | 1. 广州大学生命科学学院;2. 韶关市渔业技术推广站,韶关市水产研究所 |
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基金项目: | 广州市科技计划项目(201804010486);;广东省教育科学规划课题(2021GXJK097); |
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摘 要: | 研究通过Sanger测序法对天然雌核发育的缩骨鲫(Carassius auratus var. Suogu)线粒体DNA的Cyt b基因和控制区进行扩增和测序,并与已发表的其他鲫属鱼类的Cyt b基因进行系统进化分析,探讨缩骨鲫与其他鲫属鱼类的系统进化关系。结果表明:缩骨鲫线粒体DNA中Cyt b基因和控制区全序列分别长1 141和924 bp;其中,Cyt b基因的碱基含量为29.1%(T)、27.9%(C)、28.7%(A)和14.3%(G),控制区序列的碱基含量为32.6%(T)、20.7%(C)、32.6%(A)和14.1%(G);2种序列中G+C含量均明显低于A+T含量,且G含量偏低,显示了与其他脊椎动物线粒体核苷酸碱基含量相似的特征;控制区序列可以分为终止序列区、中央保守区和保守序列区3个区域,均识别到了对应的保守序列;基于邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建缩骨鲫与其他鲫属鱼类Cyt b基因的系统进化树表明,缩骨鲫与红鲫和淇河鲫的亲缘关系最近,而缩骨鲫与野鲫、淇河鲫和红鲫分布在同一个姐妹支系,进一步说明缩骨鲫可能起源于野鲫,是野鲫的一个地方种群。
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关 键 词: | 缩骨鲫 细胞色素b基因 控制区 系统进化分析 |
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