三明野生蕉Whirly转录因子的克隆及其在低温胁迫下的定量表达分析 |
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引用本文: | 杨洋,赖恭梯,赖钟雄.三明野生蕉Whirly转录因子的克隆及其在低温胁迫下的定量表达分析[J].热带作物学报,2014,35(8):1533-1538. |
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作者姓名: | 杨洋 赖恭梯 赖钟雄 |
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作者单位: | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所;福建农林大学园艺植物生物工程研究所;福建农林大学园艺植物生物工程研究所 |
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基金项目: | 国家香蕉产业技术体系专项资金(No. CARS-32-11);福建省农业科技平台(No.2008 N2001)。 |
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摘 要: | 以三明野生蕉叶片为材料,通过克隆获得Whirly基因的ORF,并研究Whirly基因在不同温度处理下的转录水平。结果表明:采用PT-PCR结合RACE技术,克隆得到三明野生蕉Whirly基因,其在GenBank的登录号为KC127691。Whirly的开放阅读框为738 bp,编码245个氨基酸。生物信息学分析显示,Whirly蛋白属于亲水蛋白,不具有信号肽,二级结构由α螺旋、β折叠和无规则卷曲组成,保守结构域预测显示该基因属于植物Whirly转录因子基因家族。实时荧光定量PCR分析显示,Whirly转录因子在不同低温胁迫下表达水平有较大差异,随着温度的降低,相对表达量呈"M"型变化模式,在20℃和4℃时达到较高的转录水平,结合前人研究结果可知,三明野生蕉Whirly转录因子可能参与了包括抗寒等多个抗逆途径的调控。
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关 键 词: | 三明野生蕉 Whirly 基因克隆 生物信息学 荧光定量PCR |
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