| 摘 要： | 为了挖掘调控乌苏里白鲑(Coregonus ussurinsis Berg)肌肉生长的关键候选基因,本研究对不同生长速度乌苏里白鲑的肌肉组织进行转录组测序,以期为乌苏里白鲑群体选育提供基础数据.首先,在同等条件下(从混合池中)随机选择乌苏里白鲑F2个体进行实验分组(快长组和慢长组).接着分别从快长组[体重为(219.20±38.66)g]和慢长组[体重为(74.30±17.86)g]中随机选取10尾样本,取其背部肌肉进行转录组测序.以 FDR(false discovery rate)＜0.05 且|log2(FC)|＞1(FC,fold change)为条件筛选差异表达基因并对其进行GO(gene ontology)和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析,并通过qPCR验证转录组数据的准确性.转录组测序结果显示,共筛选出2211个差异表达基因,与慢长组相比,快长组中583个差异基因表达上调及1 628个基因表达下调.GO功能注释结果显示,差异基因主要参与细胞过程和结合过程,差异基因显著富集到251条KEGG通路(P＜0.05),其中,MAPK 信号通路(MAPK signaling pathway)、PI3K-Akt 信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)、紧密连接(tight junction)、胰岛素信号通路(insulin signaling pathway)、糖酵解/糖异生(glycolysis/gluconeogenesis)和 PPAR 信号通路(PPAR signaling pathway)参与细胞生长.之后结合功能注释结果和KEGG,鉴定出肌浆/内质网钙ATP酶基因atp2a1和atp2a2、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因g6pc、生长因子结合蛋白1基因igfbp1以及肌球蛋白重链基因myh1、myh4、myh6、myh7、myh9和myh13等可能与肌肉生长密切相关的基因.本研究共筛选出10个可能与乌苏里白鲑肌肉生长相关的关键候选基因,为今后乌苏里白鲑分子标记辅助育种提供了基础数据.
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