| 小麦全基因组中YABBY基因家族的筛选与特征分析 |
| |
| 引用本文： | 葛川,杨荣,李刘军,张建诚,郑兴卫.小麦全基因组中YABBY基因家族的筛选与特征分析[J].中国农业科技导报,2019,21(8):11-18. |
| |
| 作者姓名： | 葛川 杨荣 李刘军 张建诚 郑兴卫 |
| |
| 作者单位： | 1.山西省科学技术情报研究所, 太原 030001; 2.山西省农业科学院小麦研究所, 山西 临汾 041000 |
| |
| 基金项目： | 山西省重点研发计划项目(201703D211007);山西省农业科学院农业科技创新研究项目(YCX2018413)资助。 |
| |
| 摘 要： | YABBY家族是植物特有的转录因子,在植物侧生器官极性建立和发育过程中起重要的调控作用。从全基因组水平鉴定小麦YABBY家族并进行生物信息学和表达模式分析,为研究小麦YABBY家族基因的功能奠定基础。根据已经报道的拟南芥和水稻YABBY基因,在小麦基因组数据库中执行本地BLAST程序鉴定小麦基因组中的YABBY基因,采用MEGA、GSDS、MEME和PlantCARE等软件进行生物信息学分析,并利用已公开的RNA-seq数据绘制不同发育时期和不同组织的表达谱。结果表明,在小麦基因组范围内鉴定得到18个YABBY基因家族成员,分成5个亚家族。Motif分析表明小麦YABBY蛋白均具有C2C2锌指结构域及YABBY结构域; Ta YABBY启动子区检测到与植物生长发育、激素诱导和逆境胁迫有关的顺式作用元件。RNA-Seq表达谱发现小麦YABBY基因具有明显的组织表达特异性。
|
| 关 键 词： | YABBY基因家族 小麦 生物信息 进化分析 基因功能 |
Genome-Wide Identification and Characterization of the YABBY Family Genes of Wheat (Trticum aestivum L.) |
| |
| GE Chuan,YANG Rong,LI Liujun,ZHANG Jiancheng,ZHENG Xingwei.Genome-Wide Identification and Characterization of the YABBY Family Genes of Wheat (Trticum aestivum L.)[J].Journal of Agricultural Science and Technology,2019,21(8):11-18. |
| |
| Authors: | GE Chuan YANG Rong LI Liujun ZHANG Jiancheng ZHENG Xingwei |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | YABBY gene family wheat bioinformatics phylogenetic analysis gene function |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《中国农业科技导报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《中国农业科技导报》下载免费的PDF全文 |
|
