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甘肃马鹿MyoG基因5'UTR单核苷酸多态性检测及其序列变异分析
引用本文:宋兴超,杨福合,邢秀梅,刘汇涛,岳志刚.甘肃马鹿MyoG基因5'UTR单核苷酸多态性检测及其序列变异分析[J].中国畜牧兽医,2010,37(9).
作者姓名:宋兴超  杨福合  邢秀梅  刘汇涛  岳志刚
作者单位:中国农业科学院特产研究所,吉林省特种经济动物分子生物学省部共建实验室,吉林,132109
基金项目:国家科技基础条件平台建设项目(2005DKA21102):特种经济动物标准化整理、整合及共享试点,国家科技支撑计划项目 
摘    要:为了初步探索肌细胞生成素(MyoG)基因在鹿科动物上的遗传多态性,试验采集56头甘肃马鹿的血液样品,采用PCR-SSCP和克隆测序的方法对MyoG基因(GenBank登录号:FJ746497)5'UTR部分序列进行了单核苷酸多态性(SNPs)检测及序列变异分析.结果表明:①引物P1的PCR扩增片段存在多态性,经克隆测序分析,在5'UTR-237 bp处存在G→A的转换变异,该位点表现为AA、AB和BB 3种基因型,由A和B 2个等位基因控制;对基因型,等位基因频率及群体遗传多态性分析结果发现,AA基因型频率最高,A基因为优势等位基因,该位点多态信息含量(PIC=0.194)为低度多态(PIC<0.25);经TFSEARCH 1.3分析软件预测发现,该变异可能减少了1个Sp1转录因子.②引物2的PCR扩增片段检测到1个SNP多态位点(-46 bp,G→A),表现为CC、CD和DD 3种基因型,基因型频率分布为CC>CD>DD,该位点多态信息含量(PIC=0.266)为中度多态(0.25
关 键 词:甘肃马鹿  肌细胞生成素(MyoG)基因  单核甘酸多态性(SNPs)  转录因子

Detection of Single Nucleotide Polymorphisms and DNA Sequence Variation Analysis on 5'UTR of MyoG Gene in Gansu Wapiti(Cervus Elaphus Kansuensis)
SONG Xing-chao,YANG Fu-he,XING Xiu-mei,LIU Hui-tao,YUE Zhi-gang.Detection of Single Nucleotide Polymorphisms and DNA Sequence Variation Analysis on 5'UTR of MyoG Gene in Gansu Wapiti(Cervus Elaphus Kansuensis)[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2010,37(9).
Authors:SONG Xing-chao  YANG Fu-he  XING Xiu-mei  LIU Hui-tao  YUE Zhi-gang
Abstract:
Keywords:
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