假俭草R2R3-MYB基因家族的鉴定及其在干旱胁迫下的表达模式分析 |
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引用本文: | 蒋宇佳,于元平,孙向一,周敏,吴春妍,李玉华,刘明稀.假俭草R2R3-MYB基因家族的鉴定及其在干旱胁迫下的表达模式分析[J].草地学报,2023(9):2628-2641. |
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作者姓名: | 蒋宇佳 于元平 孙向一 周敏 吴春妍 李玉华 刘明稀 |
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作者单位: | 1. 湖南农业大学农学院草业科学系 |
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基金项目: | 湖南省自然科学基金项目面上项目(2018 JJ2180);;湖南农业大学教改项目(XJJG-2020-033)资助; |
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摘 要: | R2R3-MYB家族是植物中最大的转录因子家族之一,广泛参与各种生理响应和分子调控。本研究利用假俭草(Eremochloa ophiuroides(Munro.))基因组数据和生物信息学手段鉴定了R2R3-MYB转录因子,并对系统进化、结构、顺式作用元件等进行分析;同时对R2R3-MYB转录因子响应干旱胁迫的表达模式进行分析。结果显示,假俭草中有113个R2R3-MYB成员;蛋白二级结构和三级结构都表明R2R3-MYBs蛋白都含有螺旋-转角-螺旋结构;顺式作用元件分析发现启动子区含有大量植物激素响应和胁迫响应元件,为R2R3-MYB基因进化分析提供了依据。基因表达模式分析表明,与野生型相比,抗旱突变体叶中有39个基因、根中有58个基因在一个或多个干旱时期表达量提高,推测这些R2R3-MYB基因在响应干旱胁迫过程中发挥着重要作用。本研究结果为进一步深入研究假俭草R2R3-MYB基因家族的功能奠定了基础。
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关 键 词: | 假俭草 R2R3-MYB基因家族 生物信息学 干旱胁迫 表达模式 |
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