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亚洲棉和雷蒙德氏棉PEBP家族基因的鉴定及该家族基因在陆地棉组织中表达分析
引用本文:李超,张彦楠,刘焕龙,黄先忠.亚洲棉和雷蒙德氏棉PEBP家族基因的鉴定及该家族基因在陆地棉组织中表达分析[J].作物学报,2015,41(3):394-404.
作者姓名:李超  张彦楠  刘焕龙  黄先忠
作者单位:1 石河子大学生命科学学院 / 农业生物技术重点实验室,新疆石河子 832003; 2 Plant Genome Mapping Laboratory, University of Georgia, Athens 30605, GA, USA
基金项目:本研究由国家自然科学基金项目(31360366), 新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-12-1072)和新疆生产建设兵团博士基金项目(2012BB007)资助。
摘    要:磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidyl ethanolamine-binding proteins,PEBP)基因家族广泛存在于真核生物中,在被子植物中主要起着促进或抑制开花和控制株型的作用。利用亚洲棉(Gossypium arboreum,A2)和雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii,D5)的基因组数据库,分别搜索到8个棉花PEBP同源基因,都包含4个外显子和3个内含子,编码的蛋白都存在PEBP家族的保守基序和关键氨基酸位点,表明二倍体棉花中至少存在8个PEBP家族基因。进化分析表明,8个PEBP基因分属于3个亚家族,含FLOWERING LOCUS T(FT)-like亚家族1个、TERMINAL FLOWER 1(TFL1)-like亚家族5个(包括3个TFL1和2个BFT)、MOTHER OF FT AND TFL1(MFT)-like亚家族2个。实时荧光定量PCR分析陆地棉(Gossypium hirsutum)8个PEBP基因在根、茎、叶、幼苗顶端分生组织、花、胚珠和25 d的纤维组织中的表达,表明FT1在叶片中表达量最高,其次在纤维、胚珠和花中;MFT1在各组织中均表达,但在纤维中表达量最高,其次是花和叶片中,而MFT2以在叶片中表达为主;TFL1a、TFL1b和TFL1c均在根中表达量最高,但TFL1c在叶片、花和胚珠中也有相对较高的表达;BFT1和BFT2在叶片中表达量最高,但除幼苗顶端分生组织外,BFT1在其他各组织中的表达明显高于BFT2。这些结果表明,PEBP家族基因在棉花的生长发育中可能具有不同的功能。

关 键 词:磷脂酰乙醇胺结合蛋白  亚洲棉  雷蒙德氏棉  成花素  基因表达
收稿时间:2014-09-10

Identification of PEBP Gene Family in Gossypium arboreum and Gossypium raimondii and Expression Analysis of the Gene family in Gossypium hirsutum
LI Chao,ZHANG Yan-Nan,LIU Huan-Long,HUANG Xian-Zhong.Identification of PEBP Gene Family in Gossypium arboreum and Gossypium raimondii and Expression Analysis of the Gene family in Gossypium hirsutum[J].Acta Agronomica Sinica,2015,41(3):394-404.
Authors:LI Chao  ZHANG Yan-Nan  LIU Huan-Long  HUANG Xian-Zhong
Institution:1.Key Laboratory of Agrobiotechnology / College of Life Sciences, Shihezi University, Shihezi 832003, China;2.Plant Genome Mapping Laboratory, University of Georgia, Athens 30605, GA, USA
Abstract:
Keywords:PEBP  Gossypium arboreum  Gossypium raimondii  Florigen  Gene expression
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