系统分析多组织转录组鉴定影响猪脂肪沉积的关键基因 |
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引用本文: | 翟丽维,赵延辉,李文军,邢凯,王楚端.系统分析多组织转录组鉴定影响猪脂肪沉积的关键基因[J].畜牧兽医学报,2022,53(6):1702-1711. |
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作者姓名: | 翟丽维 赵延辉 李文军 邢凯 王楚端 |
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作者单位: | 1. 中国农业大学动物科技学院,北京 100193;2. 北京农学院动物科学技术学院,北京 102206;3. 北京三元种业科技股份有限公司,北京 100029 |
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基金项目: | 国家重点研发计划(2019YFE0106800); |
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摘 要: | 旨在挖掘影响松辽黑猪脂肪沉积的关键基因及脂肪、肝和肌肉在体内的功能。本研究选择体重100 kg左右健康且背膘厚差异显著的6头(高、低各3头)松辽黑猪为试验动物,利用高通量转录组测序技术检测其脂肪、肝和背最长肌组织中基因的表达水平,鉴定不同脂肪沉积猪和不同组织中的差异表达基因,并分析差异表达基因的生物学功能。结果表明,在不同分组的猪中发现135个差异表达基因,其中部分参与了PPAR信号通路、AMPK信号通路、代谢通路、脂肪酸代谢和甘油代谢等通路。经生物学功能分析发现,EHHADH、ME1、SCD、OLR1、PHGDH、ACLY、LEP和CYP超家族基因等基因为影响猪脂肪沉积的关键基因。在不同组织的差异表达表达基因中,脂肪组织中高表达的基因显著富集在胰岛素信号通路、MAPK信号通路、三羧酸循环、氧化磷酸化等通路;肝中高表达基因显著富集在多种物质的代谢、脂肪酸的降解、氨基酸的合成等通路;背最长肌中高表达的基因主要参与了蛋白质的降解、PI3K-Akt信号通路、氧化磷酸化通路、Wnt信号通路、磷脂酰肌醇信号通路等通路。不同组间差异表达基因分析结果提示,EHHADH、ME1、SCD、OLR1、PHGDH、ACLY、LEP和CYP超家族基因等基因是影响脂肪沉积的关键基因;不同组织间差异表达基因表明,脂肪组织是脂肪合成的主要部位,而肝和肌肉组织主要涉及脂肪酸的降解。本研究结果对脂肪性状的遗传改良、机理解析有一定意义。
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关 键 词: | 松辽黑猪 多组织 转录组 系统分析 脂肪沉积 |
收稿时间: | 2021-09-07 |
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