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黄瓜绿斑驳花叶病毒安徽分离物全基因组序列测定及分析
引用本文:严丹侃,张海珊,郑红英,燕飞,章东方.黄瓜绿斑驳花叶病毒安徽分离物全基因组序列测定及分析[J].植物保护,2016,42(4):151-156.
作者姓名:严丹侃  张海珊  郑红英  燕飞  章东方
作者单位:1. 安徽省农业科学院植物保护与农产品质量安全研究所,合肥,230031;2. 浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所,杭州,310021
基金项目:公益性行业(农业)科研专项(201303028);安徽省蔬菜产业技术体系
摘    要:通过胶体金免疫层析试纸条和RT-PCR等手段对采自安徽和县的西瓜病株进行检测,确定其病原为黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)。为明确CGMMV安徽分离物CGMMV-Anhui的分类地位,进一步克隆了该病毒的全基因组序列,分析了其基因组结构特征。结果表明,CGMMV-Anhui基因组全长为6 423bp(GenBank登录号KT236095),与已报道的CGMMV的编码区的基因结构一致,仅5′和3′端非编码区核苷酸数目略有差异。将CGMMV-Anhui与已报道的分离物的全基因组序列和外壳蛋白基因序列进行系统发育分析,显示CGMMV不同分离物可分为亚洲和欧洲两个组,安徽分离物CGMMV-Anhui与亚洲分离物亲缘关系较近,可能具有共同的侵染源。

关 键 词:黄瓜绿斑驳病毒  安徽分离物  基因组  序列分析
收稿时间:8/5/2015 12:00:00 AM
修稿时间:2015/10/8 0:00:00

Cloning and sequence analysis of the genome of Cucumbergreen mottle mosaic virus Anhui isolate
Yan Dankan,Zhang Haishan,Zheng Hongying,Yan Fei,Zhang Dongfang.Cloning and sequence analysis of the genome of Cucumbergreen mottle mosaic virus Anhui isolate[J].Plant Protection,2016,42(4):151-156.
Authors:Yan Dankan  Zhang Haishan  Zheng Hongying  Yan Fei  Zhang Dongfang
Institution:1. Institute of Plant Protection and Agro-Products Safety, Anhui Academy of Agricultural Sciences, Hefei 230031, China; 2. Institute of Virology and Biotechnology, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310021, China
Abstract:
Keywords:Cucumber green mottle mosaic virus  Anhui isolate  genome  sequence analysis
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