| 羊布鲁氏菌16M基因组分泌蛋白的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 杨羽,吴清民. 羊布鲁氏菌16M基因组分泌蛋白的生物信息学分析[J]. 畜牧兽医学报, 2009, 40(7) |
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| 作者姓名： | 杨羽 吴清民 |
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| 作者单位： | 中国农业大学动物医学院,农业部人畜共患病重点开放实验室动物布病防控研究室,北京,100193 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，教育部长江学者和创新团队发展计划 |
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| 摘 要： | 对羊布鲁氏菌全基因组16M中全部3 197个氨基酸序列进行生物信息学分析.利用SignalP和TatP软件分析N-端信号肽,结果显示具有N-端信号肽的序列有288个;继而用TMHMM和Phobius软件对这288个序列进行跨膜区预测,得到不含跨膜区的蛋白208个;最后利用LipoP对这208个蛋白进行分类,得到具有信号肽的蛋白191个.使用SecretomeP软件对被预测为无信号肽的蛋白质进行分析,结果显示有391个可能通过非经典途径分泌.由于分泌蛋白在细菌的致病过程中起着重要作用,而布鲁氏菌基因组编码的大多数蛋白的功能尚未确定,因此分析和预测布鲁氏菌的分泌蛋白可为更完整地、系统地研究布鲁氏菌的分子致病机理提供非常重要的信息.
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| 关 键 词： | 布鲁氏菌 信号肽 分泌蛋白 |
Analysis of the Secreted Protein Encoding Genes in Genome of Brucella melitensis 16M |
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| YANG Yu,WU Qing-Min. Analysis of the Secreted Protein Encoding Genes in Genome of Brucella melitensis 16M[J]. Chinese Journal of Animal and Veterinary Sciences, 2009, 40(7) |
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| Authors: | YANG Yu WU Qing-Min |
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