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基于网络药理学和分子对接探究白杨素和柚皮素抗PEDV的作用机制及试验验证
引用本文:植玉鹏,刘雨桐,陈弟诗,宫萌菲,夏学妹,任玉鹏.基于网络药理学和分子对接探究白杨素和柚皮素抗PEDV的作用机制及试验验证[J].中国畜牧兽医,2024(4):1757-1772.
作者姓名:植玉鹏  刘雨桐  陈弟诗  宫萌菲  夏学妹  任玉鹏
作者单位:1. 西南民族大学畜牧兽医学院;2. 四川省动物疫病预防控制中心
摘    要:【目的】探讨白杨素和柚皮素抗猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)的作用靶点和机制,为进一步以白杨素和柚皮素开发新型抗PEDV的治疗药物提供理论依据。【方法】利用PharmMapper、TCMSP、SEA Search Server和STITCH在线数据库获得白杨素和柚皮素的潜在作用靶点,同时检索GeneCards数据库获得PEDV对宿主的作用靶点,利用在线程序Draw Venny Diagram获取白杨素、柚皮素与疾病的交集靶点。通过STRING数据库和Cytoscape 3.9.1软件构建靶蛋白互作(PPI)网络并筛选关键靶点,对靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。通过AutoDock Vina v 1.2.0软件对核心靶点及小分子进行分子对接,并分析白杨素和柚皮素与靶蛋白的结合能和结合模式,利用PyMOL v 2.5实现对接结果的可视化。采用实时荧光定量PCR和Western blotting检测白杨素和柚皮素对核心靶蛋白表达的影响。【结果】白杨素潜在抗PEDV的靶点有12个,其中白蛋白(ALB)、雌激素受体1(ESR1...

关 键 词:猪流行性腹泻病毒(PEDV)  网络药理学  分子对接  白杨素  柚皮素
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