罗氏沼虾Toll样受体基因cDNA片段的克隆及序列分析 |
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作者姓名: | 苏建 戴习林 刘红 刘伟利 高翔 刘洁 丁福江 |
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作者单位: | 上海海洋大学 水产与生命学院, 上海 201306;上海海洋大学 水产与生命学院, 上海 201306;上海海洋大学 水产与生命学院, 上海 201306;上海海洋大学 水产与生命学院, 上海 201306;上海海洋大学 水产与生命学院, 上海 201306;上海海洋大学 水产与生命学院, 上海 201306;上海申漕特种水产开发公司, 上海 201516 |
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基金项目: | 上海市科学技术委员会重点攻关项目(11391901400);上海市科技兴农重点攻关项目[沪农科攻字(2010)第1-6 号];上海市教育委员会重点学科建设项目(J50701) |
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摘 要: | 提取罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)上海养殖群体活体鳃、肌肉、肝胰腺、血液和雄性腺5种组织的总RNA;应用RT-PCR技术,从鳃组织中克隆到Toll样受体(TLR)基因部分cDNA序列,并进行生物信息学分析。基因序列分析表明:所得罗氏沼虾TLR基因cDNA序列长1 875 bp,包含1 728 bp的开放阅读框,可编码575个氨基酸残基;该部分TLR是一个跨膜蛋白,存在胞外区LRR、LRR-CT、LRR-NT结构域及关键的胞内区TIR结构域,具备Toll样受体家族的典型结构特征;TIR结构域与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)和日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)、中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)、斑节对虾(Penaeus monodon)、中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)、拟穴青蟹(Scylla paramamosian)Toll样受体基因TIR区域的氨基酸序列具有很高的相似性。
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关 键 词: | 罗氏沼虾 Toll样受体 基因克隆 序列分析 |
收稿时间: | 2013-11-17 |
修稿时间: | 2014-02-16 |
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