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1.
2.
Cong HUANG Kun LANG Wan-qiang QIAN Shu-ping WANG Xiao-mei CAO Rui HE An-ran ZHAN Meng-yao CHEN Nian-wan YANG Fei LI 《农业科学学报》2021,20(1):191-200
Invasive alien species(IAS) are species whose introduction to areas outside of their native range cause harm to economics, biodiversity, and the environment. Understanding the genetic basis of invasiveness is critical for preventing invasion by an alien species and managing IAS with eco-friendly control methods. In addition, uncovering the genomic features of IAS is essential for accurately predicting invasiveness. However, even though increasing efforts have been devoted to sequencing the genomes of IAS, there is still not an integrated genome database for the invasive biology community. Here, we first determined a list of invasive plants and animals by mining references and databases. Then, we retrieved the genomic and gene data of these IAS, and constructed a database, Invasion DB. Invasion DB encompasses 131 IAS genomes, 76 annotated IAS assemblies, and links these data to conventional functions such as searching for gene coding sequences and Pfam, KEGG, NR annotations, BLAST server, JBrowse, and downloads services. Next, we analyzed 19 invasivenessrelated gene families which confer invasiveness in insects. To study the roles of noncoding RNA in invasiveness, we also annotated 135 494 mi RNAs, 89 294 r RNAs, and 2 671 941 t RNAs from these IAS. In summary, Invasion DB is useful for studying the invasiveness at the genomic level, and thus helps to develop novel management strategies to control IAS. 相似文献
3.
【目的】总结归纳作物表型数据库的研究进展,对作物表型数据库的构建进行展望。【方法】采用文献综述法,从Web of Science、NCBI的PubMed和中国知网等常用公共文献数据库中对已发表的作物表型组学相关研究文献进行检索,据此对国内外作物表型组学研究现状进行分析,并基于其中的数据库研究,对目前的作物表型相关数据库进行了介绍。最后对作物表型组数据库构建标准及要求进行了介绍。【结果】不同于基因组学已有许多大型的、公认的、成熟的公共数据库,有关作物表型组学的数据库虽已有一些,但综合性较强、普适性较广的通用标准数据库却不是很多。因此,构建综合性作物表型组标准数据库或构建特定作物的表型组数据库,将成为该领域相关研究人员的工作重点。【结论】农业信息化是现代农业的一个必然发展趋势,作物表型组数据库的构建也是顺应时代发展的产物。今后,在充分利用各种综合和专用数据库的基础上,研究人员应在实际研究中构建自己的作物表型组数据库,增强数据管理和共享。 相似文献
4.
漯河市规划区雨洪格局空间分布特征综合量化研究 总被引:1,自引:1,他引:0
[目的]探索城市雨洪格局空间分布规律,为海绵城市建设提供参考。[方法]建立GIS数据库,ArcGIS空间模拟与SCS-CN,SWMM模型相结合,定量分析20a重现期和2h,85.43mm降雨,漯河规划区产流和积水分布特征。[结果]研究区径流量和径流系数(相等)、径流体积、峰值流量、积水区域的自相关Moran's I系数分别为0.338(p0.001),0.142(p0.001),0.101(p0.001),0.918(p0.001),表明产流与积水分布均呈现显著集聚性,土地类型和管网分布对产流影响大于积水过程,而地形影响则相反;径流量和径流系数由中心向外递减趋势,径流体积与峰值流量受汇水区面积和城市管网分布影响;高产流风险区不透水面占该区域82.73%,径流系数0.7和不透水面70%的汇水区集中在城市中心;积水区用地类型以农业用地、城市绿地、道路用地为主,分别占总面积的36.56%,21.39%,21.82%,分布特征存在显著差异。[结论]城市地表结构变化与城市产流和积水分布关系密切,综合量化方法可以直观地反映城市雨洪格局特征与趋势。 相似文献
5.
为充分利用油气管道历史失效数据,减少失效概率评估过程中的主观性,提出油气管道基本失效概率的概念及评估方法。对美国管道及危险物品安全管理局数据库的油气管道里程数据、事故数据及失效因素数据进行全面分析,采用基于事故统计的方法评估油气管道基本失效概率。结果表明:美国危险液体管道、输气集气管道、配气管道发生一般事故的基本失效概率分别为1.29次/(10^3 km·a)、2.17次/(10^4 km·a)及4.08次/(10^5 km·a),发生较大事故的基本失效概率分别为4.58次/(10^4 km·a)、1.41次/(10^4 km·a)及2.38次/(10^5 km·a),发生重大事故的基本失效概率分别为9.09次/(10^6 km·a)、9.79次/(10^6 km·a)及1.11次/(10^5 km·a)。美国基本失效概率可作为油气管道失效概率评估的基准线,也可作为风险可接受标准的依据,但不能直接应用于中国管道风险评价,需对其进行修正,建立适用于中国管道的失效数据库。 相似文献
6.
为了研究螺旋藻中的多肽成分,以钝顶螺旋藻为原料,采用超滤法提取螺旋藻中的游离肽,利用nanoUPLC-MS/MS和PEAKS Studio分析谱图信息,结合NCBI数据库进行比对和从头测序分析,获得游离肽的结构组成和百分含量信息。结果表明,利用数据库比对法和从头测序法,分别得到可信的游离肽4 485个和20 597个,匹配到的蛋白质有1 036种。数据库比对结果中的游离肽主要为七肽到二十一肽,少量为二十一肽以上;从头测序结果中游离肽主要为二肽到十六肽,少量为十六肽以上。数据库比对结果中百分含量最高的游离肽是十肽,为15.95%;从头测序结果中百分含量最高的是五肽,达到24.09%。本研究结果为螺旋藻蛋白资源的进一步开发和利用提供了依据。 相似文献
7.
陈小蓉 《农业图书情报学刊》2014,(3):24-26
伴随着特色数据库建设蓬勃发展知识产权风险问题日益突显,有必要对如何避免高校图书馆特色数据库在建设过程中产生的知识产权问题进行深入的研究。在分析特色数据库建设中的知识产权风险的基础上,提出了知识产权风险规避措施。 相似文献
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9.
本文以白羊草(Bothriochloa ischaemum)为材料,利用其目前已有的转录组序列,通过搜索、比对、功能域多态性分析、进化树构建和基因表达分析等手段,对白羊草R2R3-MYB型转录因子进行挖掘和干旱胁迫下的表达模式分析。结果从白羊草挖掘出43个R2R3-MYB转录因子,它们具有高度保守的[W]-X(19)-[W]-X(19)-[W]-X(n)-[W]-X(18)-[W]结构,主要参与生长发育、次生代谢和逆境响应等生物过程。通过进一步的分析,本研究筛选出8个可能参与干旱胁迫响应的R2R3-MYB转录因子。这为白羊草R2R3-MYB基因的功能研究和开发利用奠定了基础。 相似文献