山东栒子全长转录组测序数据组装及功能注释

山东栒子是中国山东省的特有种,现已处于极度濒危状态。目前,山东栒子的分子生物学研究较少,基因数据库资源极度缺乏,急需探究其生物学遗传信息,以加快对山东栒子的保护遗传学工作。本研究以山东栒子叶片、花、成熟果实为实验材料,利用PacBio Sequel测序平台对其转录组进行全长转录组测序。共得到高质量去冗余的转录本53932个,作为最终转录本序列。预测到的CDS区共52490个;对其SSR位点进行分析,对测序得到Unigenes进行单核苷酸至六核苷酸重复的SSR位点搜索,共搜索到26796个SSR位点。对非冗余转录本利用BLAST软件与NR、Swissprot、GO、COG、KOG、KEGG 6个数据库进行比对,一共成功注释了53319个Unigenes,其中与NR数据库进行比对中注释为苹果的的相关基因数量最多,其次是白梨和桃;在GO数据库中有33305条山东栒子Unigenes被注释分类,由生物学过程、细胞成分和分子功能三部分组成;在与COG数据库比对中,共有23910条比对到了同源序列,且一共被分为25类;在与KEGG数据库的一系列比对中,可将Unigenes映射到126条代谢通路中。本研究在高通量全长转录组水平对山东栒子进行了系统研究,这为进一步开展山东栒子的分子标记开发和挖掘优良基因提供了科学依据,从而推动山东栒子的保护与利用。     

山东栒子群落组成与结构特征分析

[目的]了解济南佛峪、红叶谷山东栒子群落的组成及结构。[方法]运用植物群落学方法对山东栒子群落组成与结构特征进行研究。[结果]山东栒子群落共有植物30科55属64种;种-多度格局及Raunkiaer频度定律分析均表明,该群落常见种的多度优势明显,稀有种属植物种类较少,群落物种分布较均匀。乔木层中黄栌、侧柏、鹅耳枥等为优势种,其重要值分别为9.46%、3.47%、2.79%;灌木层中山东栒子、连翘、陕西荚蒾、雀儿舌头、扁担杆子占有很大优势,重要值分别为15.31%、5.57%、3.70%、2.53%、2.32%;草本层物种丰富,荩草占优势,层间植物种类较少。[结论]群落常见种优势明显,物种分布较均匀,垂直结构简单,层次清晰。     

山东银莲花种子萌发特性研究

以山东特有野生花卉山东银莲花为试材,对其种子萌发特性进行了研究。结果表明:山东银莲花种子萌发启动时间长,萌发过程中无发芽高峰;最适发芽温度为20℃;赤霉素处理能明显提高种子发芽率,最适赤霉素浓度为500 mg/L;低温层积20 d后再用200 mg/L赤霉素处理效果最好,发芽率达90.67%。     

珍稀濒危植物山东栒子扦插技术研究

采用不同浓度IBA及不同枝龄的插穗对山东栒子进行扦插繁殖对比试验。结果表明:IBA处理的插穗,扦插后28天开始生根,根据不定根发生的部位可以判断山东栒子扦插属于混合生根型;1500mg L-1IBA处理的插穗生根特性最佳,生根率可达71.11%、平均每插穗生根数3.74条、总根长为18.70cm;枝龄对扦插生根影响显著,1年插穗生根率最高。