RNA-Seq技术在瘤胃微生物研究中的应用进展

反刍动物瘤胃内多种多样的微生物组成一个复杂的微生态系统,它们在瘤胃内物质消化过程中发挥重要作用。RNA-Seq技术的出现为反刍动物瘤胃微生物的研究提供了前所未有的机遇。本文主要从新一代高通量测序技术出发,阐述RNA-Seq技术在瘤胃微生物代谢酶特性、瘤胃微生物的多样性、瘤胃微生物新功能基因方面的应用,以期为瘤胃微生物的研究提供参考。     

罗非鱼维罗纳气单胞菌的分离鉴定

为了解云南某渔场罗非鱼大量死亡的原因,通过病原分离纯化,表型鉴定及16SrRNA测序分析,从发病和濒死鱼中分离纯化了4株革兰阴性杆菌(Av1、Av2、Av3、Av4),其培养特性、菌体形态、生化特征与维罗纳气单胞菌相同;用PCR方法扩增4株纯化菌的16SrRNA基因,得到大小相同的片断,选取条带明亮的Av3进行16SrRNA测序分析,与GenBank中的维罗纳气单胞菌B565株核苷酸同源性为100%。用核苷酸同源性99%以上的序列构建系统进化树,Av3与运动性气单胞菌聚类。综合动物回归试验结果,确定维罗纳气单胞菌(Aeromonas veronii)是导致该渔场罗非鱼大量死亡的主要病原之一。     

分子生物学技术在猪瘟诊断中的应用

猪瘟是由猪瘟病毒引起的一种急性、发热性、接触性传染病,可引起各种年龄猪发病.随着对猪瘟病毒研究的深入,猪瘟在一定程度上得到有效的控制.但是近年来,世界各国流行的猪瘟在流行病学、临床症状和病理变化等方面出现了一些新的变化,猪瘟的防控出现了许多新的情况.早已宣布消灭了猪瘟的一些欧洲国家又报道有猪瘟发生.我国猪瘟的发病率亦呈上升趋势,严重威胁着我国养猪业的发展,给养猪业造成极大的经济损失.论文综述了猪瘟分子生物学诊断技术的研究进展,为猪瘟的及时诊断提供参考.     

云南地区部分猪场猪呼吸道疾病综合征致病病毒感染的流行病学调查

为了解云南地区猪场猪呼吸道疾病的流行病学,从而为有效防制该疾病提供科学依据,利用ELISA和RT-PCR方法检测了春、夏、秋、冬四季,云南地区不同区域规模养殖场1 164份血清和全血样品中的猪瘟抗原、猪繁殖与呼吸综合征抗原、猪伪狂犬gE抗体、猪圆环病毒2型特异抗体。结果显示:猪瘟抗原阳性率为11.34%,猪圆环病毒2型抗体阳性率为50.86%,猪伪狂犬病病毒gE抗体阳性率为35.40%,猪繁殖与呼吸综合征抗原阳性率为44.51%。表明云南地区规模化猪场存在猪瘟病毒、猪圆环病毒2型、猪伪狂犬病野毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒感染,不同季节和猪群年龄阶段感染情况有一定差异性。     

Viili中乳酸菌的初步分离和鉴定

[目的]分离和鉴定Viili中的主要乳酸菌,为开发新型乳制品提供依据。[方法]首先,对Viili中的细菌进行活化、分离和纯化;然后,接种于相应的培养基上进行培养,从生长特性、形态特征以及生理生化特性对分离菌进行鉴定。[结果]Viili中主要含有乳酸乳球菌乳酸亚种（L.lactissub sp.lactis）、乳酸乳球菌乳脂亚种（L.lactissub sp.cremoris）、乳酸乳球菌乳酸亚种二乙酰乳酸亚种（L.lactissub sp.diacetylactis）和肠膜明串球菌乳脂亚种（L.mesenteroidessub sp.cremoris）。[结论]Viili中乳酸菌的种类比较丰富,其中乳酸乳球菌二乙酰乳酸亚种和肠膜明串球菌乳脂亚种在我国乳制品中很少分离到。     

用筛选的乳酸菌复合活菌制剂饲喂雏鸡试验

应用有益微生物制成的微生态制剂 ,是近年发展起来的一种新型饲料添加剂。它具有防病抗病 ,提高动物生产性能 ,对动物无毒无害 ,无残留等特点。在饲用微生物添加剂生产用菌种方面 ,各国都在努力筛选寻求自己的菌源。 1989年美国食品药物管理局和美国饲料公定协会公布了 43种可以直接在畜禽生产上使用的微生物 ,但应用较多的是乳酸杆菌、粪链球菌、酵母菌和芽孢杆菌[1] 。云南农业大学动物科技学院微生物室近年来从动物消化道及饲料中分离到 2 0 0余株乳酸菌[2 ] ,根据其产酸、抗盐酸、抗胆盐、增殖速度及体外抑菌性能 ,从中筛选到 4株菌株用…     

独龙牛瘤胃细菌纤维素酶基因克隆

【目的】从分子生物学水平对独龙牛的瘤胃纤维素酶基因资源进行筛选及酶学特性研究,为后续开发利用新的纤维素酶提供参考依据,也为揭示瘤胃微生物降解纤维素的作用机理打下基础。【方法】提取独龙牛瘤胃微生物中的大片段基因组DNA,构建瘤胃微生物基因组文库,并进行纤维素酶活性筛选,筛选获得的高活性基因经测序后进行生物信息学分析与酶学性质研究。【结果】从独龙牛瘤胃中共获得20352个阳性克隆,白斑率达92%,构建的瘤胃微生物基因组文库容量899.6 Mb,空载率1.82%。从瘤胃微生物基因组文库筛选获得2个具有纤维素酶活性的阳性克隆(B1和B2),其中,B1基因序列长1230 bp,编码409个氨基酸,基因编码产物与来自Ruminococcus albus纤维素酶基因编码产物(β-1,4-内切葡聚糖酶,Gen Bank登录号P23661.1)的覆盖率高达99%,其同源性高达97%;B2基因序列长1002bp,编码333个氨基酸,基因编码产物与Uncultured microorganism纤维素酶基因编码产物(纤维糊精酶,Gen Bank登录号ADB80112.1)的覆盖率高达99%,其同源性为83%。B1和B2基因可在Rosetta原核表达宿主菌中成功诱导表达,B1纤维素酶的最适pH为6.0,最适温度40℃;B2纤维素酶的最适pH为6.0,最适温度40~50℃。【结论】从构建的独龙牛瘤胃微生物基因文库中筛选获得2株具有较高活力的纤维素酶(B1和B2),其中,B1为β-1,4-内切葡聚糖酶,而B2为新的纤维糊精酶,可为纤维素的体外降解提供新型材料。     

2009-2010年云南部分猪场猪主要传染病血清流行病调查

为了探查2009-2010年云南部分猪场对猪主要传染病疫苗接种后的免疫效果,本试验主要通过ELISA方法对样品进行血清流行病调查。结果表明,猪瘟病毒(classical swine fever virus,CSFV)抗体阳性率为84.33%(1211/1436);猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)抗体阳性率为74.84%(803/1073);猪圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV2)抗体阳性率为0.00%(0/80);猪伪狂犬病病毒(pseudorabies virus,PRV)抗体阳性率为62.26%(287/461);猪细小病毒(porcine parvovirus,PPV)抗体阳性率为54.25%(83/153);日本乙型脑炎抗体阳性率为63.33%(76/120)。提高PRRSV、PRV、PPV和乙脑疫苗的使用效果是云南省内猪场解决母猪流产的有效途径。     

螺旋藻的营养价值及药用特性

 螺旋藻是一类可供人和动物食用药用的微生物，重点阐述了螺旋藻及其多糖的抗疲劳、抗福射、抗癌、抗病毒作用，营养特性及其免疫力提高作用。     

瘤胃纤维素酶来源的微生物及其作用机制

纤维素酶是一种高效的生物催化剂,在纤维素类物质的利用方面发挥着重要作用.瘤胃来源的纤维素酶是一类能够分解瘤胃中纤维素类物质的酶或酶系,能将纤维素类物质分解成葡萄糖供给动物生长所需.对纤维素进行了概述,分析了瘤胃纤维素酶来源的细菌、真菌和其他微生物种类和分泌的纤维素酶以及瘤胃各类微生物对纤维素的降解过程,并对纤维素酶的种类和降解机理进行了阐述,为进一步研究瘤胃纤维素酶提供参考.