T-RFLP指纹图谱技术分析细菌型微生物肥料菌种稳定性

[目的]建立一种分析微生物肥料菌种稳定性的T-RFLP指纹图谱技术。[方法]采用T-RFLP指纹图谱技术对进口细菌型微生物肥料菌种的稳定性进行分析。[结果]样品中优势菌的T-RFs片段主要是87、246、247、330 bp,其中330 bp为主要片段,Shannon多样性指数和均一性指数测定结果表明,不同批次产品间差异性较小,微生物群落结构较稳定。[结论]建立了微生物肥料菌种稳定性分析的T-RFLP指纹图谱技术,为进出口微生物肥料产品提供了一种快速分析方法。     

猪嗜淋巴疱疹病毒3型TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立及应用

依据GenBank公布的猪嗜淋巴疱疹病毒3型(porcine lymphotropic herpesviruses 3,PLHV-3)DNA序列,设计特异性引物,优化反应条件,建立荧光定量PCR方法,并对方法的灵敏度、特异性和重复性进行试验。得出方法的线性范围为:8.2×101~8.2×107,灵敏度可达82个拷贝,方法的特异性高,只能检测pMD18-T/PLHV3重组质粒,另外5种对照病原均未检出;方法的重复性好,对不同浓度的pMD18-T/PLHV3重组质粒分别扩增6次,结果重复性好。使用建立的方法检测100份临床样品,同时与普通PCR方法比较,显示荧光定量PCR检出率比普通PCR高,具有较高的灵敏度和准确性。结果表明:建立的荧光定量PCR可用于PLHV-3的临床快速诊断。     

副猪嗜血杆菌环介导等温扩增检测方法的建立

本研究旨在建立检测副猪嗜血杆菌(Hps)的新方法。根据GenBank上发表的不同血清型Hps的16S rRNA序列,找出高度保守区域,再针对该区域设计了4条特异性引物,建立了Hps环介导等温扩增法(LAMP)。试验结果表明,LAMP方法在恒温(63℃)条件下特异性强,比PCR方法敏感100倍,鉴于目前副猪嗜血杆菌分离培养和鉴定的复杂性,LAMP操作简单、成本低,整个扩增反应在1 h内即可完成,为检测Hps提供了一个快速简便的分子生物学方法。     

猪瘟病毒RT-LAMP快速检测方法的建立

本研究设计了4条针对猪瘟病毒6个位点的特异性引物,建立了一种灵敏、特异、快速的猪瘟病毒体外等温扩增(RT-LAMP)检测方法,所建立的方法能够特异地检测出猪瘟病毒(classical swine fever virus,CSFV)的存在,检测PRV、PRRSV、PCV-2等病毒均为阴性;灵敏度高,所建立的CSFV-RT-LAMP方法灵敏度为10-5,总RNA的检测阈值约为1pg;反应快速,整个扩增反应可在1h内完成;操作简单,不需要PCR仪等复杂的仪器,结果可经肉眼观察及电泳检测。本试验为猪瘟的现场快速检测提供更加简便、快速的方法,可以满足基层检疫的需要。     

猪血浆蛋白粉中IgG含量的酶联免疫检测方法研究

猪血浆蛋白粉已经成为断奶仔猪理想和必需的蛋白饲料来源。评价血浆蛋白粉质量的重要指标就是其中IgG的含量。研究通过制备猪IgG单克隆抗体,调试优化后建立了相应的酶联免疫检测方法。该方法最低检测浓度为10μg/g,阴性血浆蛋白粉添加10(1%)、100(10%)、200mg/g(20%)猪IgG标准品后用本方法测定回收率为73.1%～104.6%,批内、批间变异系数小于15%,可基本满足血浆蛋白粉质量监控需要。     

猪、鼠、羊补体C3d分子cDNA的克隆及序列分析

为比较不同动物的补体C3d基因序列,本研究参考已报道的人、鼠、牛的C3d基因序列设计引物,分别从小鼠、猪、羊的肝脏组织中扩增获得鼠、猪、羊的补体C3d基因.以鼠、猪、羊的肝脏中提取总RNA为模板,通过RT-PCR扩增出C3d分子的cDNA克隆到pMD18-T载体中,转化大肠杆菌,经酶切鉴定后进行序列测定,并利用生物信息学工具软件对3种C3d蛋白的理化和生物学性质进行分析.鼠C3d基因与人、猪、羊C3d基因的同源性分别为83%、82%、81%,牛和羊C3d基因的同源性为94%.鼠、猪、羊的补体C3d分子与受体CR2结合的功能区同源性很高,只有个别位置氨基酸发生了突变,可能具有相同的结构和功能.     

水泡性口炎病毒血清型特异LUX实时荧光RT-PCR检测方法的建立

采用LUX荧光核酸扩增技术原理,以水泡性口炎病毒（VSV）NJ、IND型NS基因为模板分别设计并合成单标记LUX荧光引物,建立血清型特异的VSV荧光RT—PCR检测方法。试验表明,两种型特异的LUX荧光RT-PCR能分别特异地鉴定VSV血清型,对口蹄疫、猪水泡病等病毒以及对照细胞、健康动物组织RNA样品的检测结果均为阴性。对比检测试验表明,LUX荧光RT—PCR的检测敏感性比常规RT-PCR提高达10倍以上,对VSV细胞增殖病毒液的检测灵敏度可达1 TCID50。对人工感染豚鼠样品以及临床样品的检测试验证实,该LUX荧光RT—PCR可有效检测到人工感染动物组织以及进口牛临床样品中的水泡性口炎病毒,并能鉴定感染病毒血清型。所报道的检测方法,包括样品核酸提取、LUX荧光RT—PCR以及熔解曲线分析,可在3h内完成。     

基因编辑作物的发展及检测监管现状

随着以ZFN、TALEN和CRISPR/Cas9技术为代表的基因编辑技术的不断发展,越来越多的基因编辑作物不断问世,围绕着基因编辑作物的监管态度和检测技术将成为新的问题。笔者简要介绍了目前运用基因编辑技术培育的基因修饰作物的现状,并以ZFN技术为代表,分析了世界上有关国家对基因编辑作物的监管态度,并针对基因编辑作物检测可能存在的问题进行了分析。旨在为我国未来可能出现的基因编辑作物进出口的监管和检测工作提供参考。